Sperm Heterogeneity Accounts for Sperm DNA Methylation Variations Observed in the Caput Epididymis, Independently From DNMT/TET Activities
Notice bibliographique
Résumé
Following their production in the testis, spermatozoa enter the epididymis where they gain their motility and fertilizing abilities. This post-testicular maturation coincides with sperm epigenetic profile changes that influence progeny outcome. While recent studies highlighted the dynamics of small non-coding RNAs in maturing spermatozoa, little is known regarding sperm methylation changes and their impact at the post-fertilization level. Fluorescence-activated cell sorting (FACS) was used to purify spermatozoa from the testis and different epididymal segments (i.e., caput, corpus and cauda) of CAG/su9-DsRed2; Acr3-EGFP transgenic mice in order to map out sperm methylome dynamics. Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS-Seq) performed on DNA from these respective sperm populations indicated that high methylation changes were observed between spermatozoa from the caput vs. testis with 5,546 entries meeting our threshold values (q value <0.01, methylation difference above 25%). Most of these changes were transitory during epididymal sperm maturation according to the low number of entries identified between spermatozoa from cauda vs. testis. According to enzymatic and sperm/epididymal fluid co-incubation assays, (de)methylases were not found responsible for these sperm methylation changes. Instead, we identified that a subpopulation of caput spermatozoa displayed distinct methylation marks that were susceptible to sperm DNAse treatment and accounted for the DNA methylation profile changes observed in the proximal epididymis. Our results support the paradigm that a fraction of caput spermatozoa has a higher propensity to bind extracellular DNA, a phenomenon responsible for the sperm methylome variations observed at the post-testicular level. Further investigating the degree of conservation of this sperm heterogeneity in human will eventually provide new considerations regarding sperm selection procedures used in fertility clinics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».