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Enregistrement W4220996963 · doi:10.3389/fcell.2022.834519

Sperm Heterogeneity Accounts for Sperm DNA Methylation Variations Observed in the Caput Epididymis, Independently From DNMT/TET Activities

2022· article· en· W4220996963 sur OpenAlexafffund
Hong Chen, Marie‐Pier Scott‐Boyer, Arnaud Droit, Claude Robert, Clémence Belleannée

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cell and Developmental Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSick Kids Foundation
Mots-clésSpermAndrologyBiologyDNA methylationEpididymisMethylationEpigeneticsGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following their production in the testis, spermatozoa enter the epididymis where they gain their motility and fertilizing abilities. This post-testicular maturation coincides with sperm epigenetic profile changes that influence progeny outcome. While recent studies highlighted the dynamics of small non-coding RNAs in maturing spermatozoa, little is known regarding sperm methylation changes and their impact at the post-fertilization level. Fluorescence-activated cell sorting (FACS) was used to purify spermatozoa from the testis and different epididymal segments (i.e., caput, corpus and cauda ) of CAG/su9-DsRed2; Acr3-EGFP transgenic mice in order to map out sperm methylome dynamics. Reduced representation bisulfite sequencing (RRBS-Seq) performed on DNA from these respective sperm populations indicated that high methylation changes were observed between spermatozoa from the caput vs. testis with 5,546 entries meeting our threshold values (q value <0.01, methylation difference above 25%). Most of these changes were transitory during epididymal sperm maturation according to the low number of entries identified between spermatozoa from cauda vs. testis. According to enzymatic and sperm/epididymal fluid co-incubation assays, (de)methylases were not found responsible for these sperm methylation changes. Instead, we identified that a subpopulation of caput spermatozoa displayed distinct methylation marks that were susceptible to sperm DNAse treatment and accounted for the DNA methylation profile changes observed in the proximal epididymis. Our results support the paradigm that a fraction of caput spermatozoa has a higher propensity to bind extracellular DNA, a phenomenon responsible for the sperm methylome variations observed at the post-testicular level. Further investigating the degree of conservation of this sperm heterogeneity in human will eventually provide new considerations regarding sperm selection procedures used in fertility clinics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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