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Enregistrement W4221018126 · doi:10.3390/cells11060975

Thyroidal Transcriptomic Profiles of Pathoadaptive Responses to Congenital Hypothyroidism in XB130 Knockout Mice

2022· article· en· W4221018126 sur OpenAlexafffund
Junichi Sugihara, Aaron Wong, Hiroki Shimizu, Jinbo Zhao, Hae-Ra Cho, Yingchun Wang, Samuel Refetoff, Peter Arvan, Mingyao Liu

Notice bibliographique

RevueCells · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity Health Network
Mots-clésThyroidDownregulation and upregulationEndocrinologyInternal medicineCongenital hypothyroidismBiologyKnockout mouseTranscriptomeExtracellular matrixGene expressionMedicineGeneCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital hypothyroidism is a genetic condition in which the thyroid gland fails to produce sufficient thyroid hormone (TH), resulting in metabolic dysfunction and growth retardation. Xb130−/− mice exhibit perturbations of thyrocyte cytoskeleton and polarity, and develop postnatal transient growth retardation due to congenital hypothyroidism, leading ultimately to multinodular goiter. To determine the underlying mechanisms, we performed transcriptomic analyses on thyroid glands of mice at three age points: week 2 (W2, before visible growth retardation), W4 (at the nadir of growth); and W12 (immediately before full growth recovery). Using gene set enrichment analysis, we compared a defined set of thyroidal genes between Xb130+/+ and Xb130−/− mice to identify differentially enriched gene clusters. At the earliest postnatal stage (W2), the thyroid glands of Xb130−/− mice exhibited significantly downregulated gene clusters related to cellular metabolism, which continued to W4. Additionally, mutant thyroids at W4 and W12 showed upregulated gene clusters related to extracellular matrix, angiogenesis, and cell proliferation. At W12, despite nearly normal levels of serum TH and TSH and body size, a significantly large number of gene clusters related to inflammatory response were upregulated. Early postnatal TH deficiency may suppress cellular metabolism within the thyroid gland itself. Upregulation of genes related to extracellular matrix and angiogenesis may promote subsequent thyroid growth. Chronic inflammatory responses may contribute to the pathogenesis of multinodular goiter in later life. Some of the pathoadaptive responses of Xb130−/− mice may overlap with those from other mutations causing congenital hypothyroidism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,213
Score d'incertitude au seuil0,698

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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