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Enregistrement W4221038945 · doi:10.1002/cphc.202200161

Raman Optical Activity of N‐Acetyl‐L‐Cysteine in Water and in Methanol: The “Clusters‐in‐a‐Liquid” Model and ab Initio Molecular Dynamics Simulations

2022· article· en· W4221038945 sur OpenAlexafffund
Yanqing Yang, Joseph Cheramy, Martin Brehm, Yunjie Xu

Notice bibliographique

RevueChemPhysChem · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMolecular spectroscopy and chirality
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsche ForschungsgemeinschaftCanada Foundation for InnovationUniversity of Alberta
Mots-clésRaman spectroscopyRaman optical activityChemistrySolvationIntermolecular forceMolecular dynamicsAb initioComputational chemistrySolvent effectsPolarizabilityAb initio quantum chemistry methodsChemical physicsSolventPhysical chemistryMoleculeOrganic chemistryPhysicsOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Raman and Raman Optical Activity (ROA) spectra of N-acetyl-L-cysteine (NALC), a flexible chiral molecule, were measured in water and in methanol to evaluate the solvent effects. Two different solvation approaches, that is, the DFT based "clusters-in-a-liquid" solvent model and the ab initio molecular dynamics (AIMD) simulations, were applied to simulate the Raman and ROA spectra. Systematic conformational searches were carried out using a recently developed conformational searching tool, CREST, with the inclusion of polarizable continuum model of water and of methanol. The CREST candidates of NALC and the NALC-solvent complexes were re-optimized and their Raman and ROA simulations were done at the B3LYP-D3BJ/def2-TZVP and the B3LYP-aug-cc-pVDZ//cc-pVTZ levels. Also, AIMD simulations, which includes some anharmonic effects and all intermolecular interactions in solution, were performed. By empirically weighting the computed Raman and ROA spectra of each conformer, good agreements with the experimental data were achieved with both approaches, while AIMD offered some improvements in the carbonyl and in the low wavenumber regions over the static DFT approach. The pros and cons of these two different approaches for accounting the solvent effects on Raman and ROA of this flexible chiral system will also be discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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