Raman Optical Activity of N‐Acetyl‐L‐Cysteine in Water and in Methanol: The “Clusters‐in‐a‐Liquid” Model and ab Initio Molecular Dynamics Simulations
Notice bibliographique
Résumé
Raman and Raman Optical Activity (ROA) spectra of N-acetyl-L-cysteine (NALC), a flexible chiral molecule, were measured in water and in methanol to evaluate the solvent effects. Two different solvation approaches, that is, the DFT based "clusters-in-a-liquid" solvent model and the ab initio molecular dynamics (AIMD) simulations, were applied to simulate the Raman and ROA spectra. Systematic conformational searches were carried out using a recently developed conformational searching tool, CREST, with the inclusion of polarizable continuum model of water and of methanol. The CREST candidates of NALC and the NALC-solvent complexes were re-optimized and their Raman and ROA simulations were done at the B3LYP-D3BJ/def2-TZVP and the B3LYP-aug-cc-pVDZ//cc-pVTZ levels. Also, AIMD simulations, which includes some anharmonic effects and all intermolecular interactions in solution, were performed. By empirically weighting the computed Raman and ROA spectra of each conformer, good agreements with the experimental data were achieved with both approaches, while AIMD offered some improvements in the carbonyl and in the low wavenumber regions over the static DFT approach. The pros and cons of these two different approaches for accounting the solvent effects on Raman and ROA of this flexible chiral system will also be discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».