Antimicrobial Susceptibility Profiles of Bacteria Commonly Isolated from Farmed Salmonids in Atlantic Canada (2000–2021)
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial infection and antimicrobial resistance are important constraints in the production and sustainability of farmed salmonids. This retrospective study aimed to describe the frequency of bacterial isolates and antimicrobial resistance profiles in salmonid aquaculture in Atlantic Canada. Bacterial isolates and antimicrobial susceptibility testing (AST) results assessed by disk diffusion testing were summarized for 18,776 Atlantic salmon (Salmo salar) and rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) samples from 2291 unique cases submitted to the Atlantic Veterinary College, Aquatic Diagnostic Services Bacteriology Laboratory from 2000 to 2021. Kidney was the most commonly submitted tissue (60.29%, n = 11,320), and these specimens were mostly submitted as swabs (63.68%, n = 11,957). The most prevalent pathogens detected in these cases were Yersinia ruckeri type 1 (5.54%, n = 127), Renibacterium salmoninarum (2.10%, n = 48), Aeromonas salmonicida (atypical) (1.66%, n = 38), and Pseudomonas fluorescens (1.22%, n = 28). Most bacterial isolates tested (n = 918) showed resistance to florfenicol, oxytetracycline, ormetoprim-sulfadimethoxine, and trimethoprim-sulfamethoxazole, but not to enrofloxacin. This report provides baseline data for antimicrobial surveillance programs that investigate emerging antimicrobial resistance trends in salmonid aquaculture in Atlantic Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».