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Enregistrement W4221056440 · doi:10.7554/elife.72908

Structural basis of Plasmodium vivax inhibition by antibodies binding to the circumsporozoite protein repeats

2022· article· en· W4221056440 sur OpenAlexafffund
Iga Kucharska, Lamia Hossain, Danton Ivanochko, Qiren Yang, John L. Rubinstein, Régis Pomès, Jean‐Philippe Julien

Notice bibliographique

RevueeLife · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthOntario Research FoundationCanada Research ChairsCanadian Institutes of Health ResearchSick Kids FoundationCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésCircumsporozoite proteinPlasmodium vivaxBiologyAntibodyVirologyPlasmodium falciparumComputational biologyApicomplexaGeneticsCell biologyMalariaEpitopeImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Malaria is a global health burden, with Plasmodium falciparum (Pf) and Plasmodium vivax (Pv) responsible for the majority of infections worldwide. Circumsporozoite protein (CSP) is the most abundant protein on the surface of Plasmodium sporozoites, and antibodies targeting the central repeat region of CSP can prevent parasite infection. Although much has been uncovered about the molecular basis of antibody recognition of the PfCSP repeats, data remains scarce for PvCSP. Here, we performed molecular dynamics simulations for peptides comprising the PvCSP repeats from strains VK210 and VK247 to reveal how the PvCSP central repeats are highly disordered, with minor propensities to adopt turn conformations. Next, we solved eight crystal structures to unveil the interactions of two inhibitory monoclonal antibodies (mAbs), 2F2 and 2E10.E9, with PvCSP repeats. Both antibodies can accommodate subtle sequence variances in the repeat motifs and recognize largely coiled peptide conformations that also contain isolated turns. Our structural studies uncover various degrees of Fab-Fab homotypic interactions upon recognition of the PvCSP central repeats by these two inhibitory mAbs, similar to potent mAbs against PfCSP. These findings augment our understanding of host -Plasmodium interactions and contribute molecular details of Pv inhibition by mAbs to unlock structure-based engineering of PvCSP-based vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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