MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4221085387 · doi:10.1101/2022.03.10.22271799

Assessment of Androgen Receptor splice variant-7 as a biomarker of clinical response in castration-sensitive prostate cancer

2022· preprint· en· W4221085387 sur OpenAlexfundno aff
Adam G. Sowalsky, Ines Figueiredo, Rosina T. Lis, Ilsa Coleman, Bora Gürel, Denisa Bogdan, Wei Yuan, Joshua W. Russo, John R. Bright, Nichelle C. Whitlock, Shana Y. Trostel, Anson T. Ku, Radhika A. Patel, Lawrence D. True, Jonathan Welti, Juan M. Jiménez‐Vacas, Daniel Nava Rodrigues, Ruth Riisnaes, Antje Neeb, Cynthia T. Sprenger, Amanda Swain, Scott Wilkinson, Fatima Karzai, William L. Dahut, Steven P. Balk, Eva Corey, Peter S. Nelson, Michael C. Haffner, Stephen R. Plymate, Johann S. de Bono, Adam Sharp

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFoghorn TherapeuticsGilead SciencesNational Cancer InstituteGenentechJanssen Research and DevelopmentNational Institutes of HealthSierra OncologyV Foundation for Cancer ResearchAstellas PharmaEisaiProstate Cancer UKNational Institute for Health and Care ResearchMacroGenicsDOD Prostate Cancer Research ProgramVertex PharmaceuticalsBristol-Myers SquibbAstraZenecaMovember FoundationSanofiPfizerWellcome TrustCancer Research UKDoris Duke Charitable FoundationU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésProstate cancerAndrogen receptorBiomarkerAndrogen deprivation therapyImmunohistochemistryOncologyMedicineCancer researchProstatespliceInternal medicineAndrogenMessenger RNACancerBiologyHormoneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Therapies targeting the androgen receptor (AR) have improved the outcome for patients with castration-sensitive prostate cancer (CSPC). Expression of the constitutively active AR splice variant-7 (AR-V7) has shown clinical utility as a predictive biomarker of AR-targeted therapy resistance in castration-resistant prostate cancer (CRPC), but its importance as predictive biomarker in CSPC remains understudied. Methods We explored multiple approaches to quantify AR-V7 mRNA and protein in prostate cancer cell lines and patient-derived xenograft (PDX) models, in both publicly available and independent institutional clinical cohorts, to identify reliable approaches for detecting AR-V7 mRNA and protein, and its association with clinical outcome. Results In publicly available benign prostate, CSPC and CRPC cohorts, AR-V7 mRNA was much less abundant when detected using reads across splice boundaries than when considering isoform-specific exonic reads. The RM7 AR-V7 antibody had increased sensitivity and specificity for AR-V7 protein detection by immunohistochemistry (IHC) in CRPC cohorts and identified AR-V7 protein reactivity very rarely in CSPC cohorts, when compared to the EPR15656 AR-V7 antibody. Using multiple CRPC PDX models, we demonstrated that AR-V7 expression was exquisitely sensitive to hormonal manipulation. In CSPC cohorts, AR-V7 protein quantification by either assay did not associate with time to development of castration-resistance or overall survival, and intense neoadjuvant androgen-deprivation therapy did not lead to significant detectable AR-V7 mRNA or staining following treatment, and neither pre- nor post-treatment AR-V7 levels associated with the volume of residual disease after therapy. Conclusion This study demonstrates that further analytical validation and clinical qualification is required before AR-V7 can be considered for clinical use in CSPC as a predictive biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,459
Écart entre enseignants0,373 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxiv→Même sujetProstate Cancer Treatment and Research→Travaux en français237 207→