Molecular Response Mechanism of Pseudomonas Nicosulfuronedens LAM1902 to A Typical Sulfonylurea Herbicide Nicosulfuron
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The overuse of the herbicide nicosulfuron (NS) has become a global environmental concern. As a potential bioremediation technology, the microbial degradation of NS shows much promise; however, the detailed mechanisms of microbial taxa responding to NS exposure require further study. An isolated soil-borne bacteria Pseudomonas nicosulfuronedens LAM1902 displaying NS degradabilities was used to characterize the molecular responses to NS exposure, and LAM1902 can degrade exceed 95% of 50 mg/L nicosulfuron under the optimal conditions. Using transcriptomic sequencing, RNA-Seq results indicated that 1102 differentially expressed genes (DEGs) were up-regulated and 702 down-regulated in response to NS. Among them, “ABC transporters,” “sulfur metabolism,” and “ribosome” gene pathways were significantly enriched (p ≤ 0.05). Several gene pathways involved in the glycolysis and pentose phosphate pathways, a two-component regulation system, as well as in bacterial chemotaxis metabolisms were up-regulated under NS exposure. Surprisingly, NS exposure showed positive effects on the production of oxalic acid that is synthesized by genes encoding glycolate oxidase through the glyoxylate cycle pathway. The results suggest that P. nicosulfuronedens LAM1902 adopt acid metabolites production strategies in response to NS, with concomitant NS degradation. Meanwhile, strain LAM1902 likely grows and survives amid NS stress by increased energy production. The present studies provide a glimpse at the molecular response of microorganisms to sulfonylurea pesticide toxicity and a potential framework for future mechanistic studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».