Valosin-containing protein-regulated endoplasmic reticulum stress causes NOD2-dependent inflammatory responses
Notice bibliographique
Résumé
NOD2 polymorphisms may affect sensing of the bacterial muramyl dipeptide (MDP) and trigger perturbed inflammatory responses. Genetic screening of a patient with immunodeficiency and enteropathy revealed a rare homozygous missense mutation in the first CARD domain of NOD2 (ENST00000300589; c.160G > A, p.E54K). Biochemical assays confirmed impaired NOD2-dependent signaling and proinflammatory cytokine production in patient's cells and heterologous cellular models with overexpression of the NOD2 mutant. Immunoprecipitation-coupled mass spectrometry unveiled the ATPase valosin-containing protein (VCP) as novel interaction partner of wildtype NOD2, while the binding to the NOD2 variant p.E54K was abrogated. Knockdown of VCP in coloncarcinoma cells led to impaired NF-κB activity and IL8 expression upon MDP stimulation. In contrast, tunicamycin-induced ER stress resulted in increased IL8, CXCL1, and CXCL2 production in cells with knockdown of VCP, while enhanced expression of these proinflammatory molecules was abolished upon knockout of NOD2. Taken together, these data suggest that VCP-mediated inflammatory responses upon ER stress are NOD2-dependent.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».