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Enregistrement W4221120430 · doi:10.1016/j.celrep.2021.110282

A bidirectional competitive interaction between circHomer1 and Homer1b within the orbitofrontal cortex regulates reversal learning

2022· article· en· W4221120430 sur OpenAlexaff
Alexander Hafez, Amber Zimmerman, Grigorios Papageorgiou, Jayapriya Chandrasekaran, Stephen Amoah, Rixing Lin, Evelyn Lozano, Caroline Pierotti, Michela Dell’Orco, Brigham J. Hartley, Begüm Alural, Jasmin Lalonde, John M. Esposito, Sabina Berretta, Alessio Squassina, Caterina Chillotti, Georgios Voloudakis, Zhiping Shao, John F. Fullard, Kristen Brennand, Gustavo Turecki, Panos Roussos, Roy H. Perlis, Stephen J. Haggarty, Nora I. Perrone‐Bizzozero, Jonathan L. Brigman, Nikolaos Mellios

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismClinical and Translational Science Collaborative of Cleveland, School of Medicine, Case Western Reserve UniversityNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Mental HealthTürkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma KurumuBrain and Behavior Research FoundationNew York Stem Cell FoundationU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésGene knockdownNeuroscienceOrbitofrontal cortexBiologyIn vivoMessenger RNAGene isoformCell biologyGenePrefrontal cortexGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although circular RNAs (circRNAs) are enriched in the brain, their relevance for brain function and psychiatric disorders is poorly understood. Here, we show that circHomer1 is inversely associated with relative HOMER1B mRNA isoform levels in both the orbitofrontal cortex (OFC) and stem-cell-derived neuronal cultures of subjects with psychiatric disorders. We further demonstrate that in vivo circHomer1 knockdown (KD) within the OFC can inhibit the synaptic expression of Homer1b mRNA. Furthermore, we show that circHomer1 directly binds to Homer1b mRNA and that Homer1b-specific KD increases synaptic circHomer1 levels and improves OFC-mediated behavioral flexibility. Importantly, double circHomer1 and Homer1b in vivo co-KD results in a complete rescue in circHomer1-associated alterations in both chance reversal learning and synaptic gene expression. Lastly, we uncover an RNA-binding protein that can directly bind to circHomer1 and promote its biogenesis. Taken together, our data provide mechanistic insights into the importance of circRNAs in brain function and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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