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Enregistrement W4221138151 · doi:10.3390/genes13040587

SORL1 Polymorphisms in Mexican Patients with Alzheimer’s Disease

2022· article· en· W4221138151 sur OpenAlexaff
Danira Toral-Ríos, Elizabeth Ruiz-Sánchez, Nancy Martínez‐Rodríguez, Marlene Maury-Rosillo, Óscar Rosas‐Carrasco, Fernando Becerril-Pérez, Francisco Mena‐Barranco, Rosa Carvajal-García, Daniela Silva‐Adaya, Yair Delgado-Namorado, Gerardo Ramos-Palacios, Carmen Sánchez‐Torres, Victoria Campos‐Peña

Notice bibliographique

RevueGenes · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseAlzheimer's diseaseGeneticsBiologyMedicineEvolutionary biologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study evaluated the risk effect of 12 Single Nucleotide Polymorphisms in the SORL1 gene in the Mexican population using Late-Onset Alzheimer’s Disease (LOAD) and control subjects. Considering APOE as the strongest genetic risk factor for LOAD, we conducted interaction analyses between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and the APOE genotype. Methods: Patients were interviewed during their scheduled visits at neurologic and geriatric clinics from different institutions. The LOAD diagnosis included neurological, geriatric, and psychiatric examinations, as well as the medical history and neuroimaging. Polymorphisms in SORL1 were genotyped by real-time PCR in 156 subjects with LOAD and 221 controls. APOE genotype was determined in each study subject. Allelic, genotypic, and haplotypic frequencies were analyzed; an ancestry analysis was also performed. Results: The A/A genotype in rs1784933 might be associated with an increased LOAD risk. Two blocks with high degree linkage disequilibrium (LD) were identified. The first block composed by the genetic variants rs668387, rs689021 and rs641120 showed a positive interaction (mainly the rs689021) with rs1784933 polymorphism. Moreover, we found a significant association between the APOE ε4 allele carriers and the variant rs2070045 located in the second LD block. Conclusion: The rs1784933 polymorphism is associated with LOAD in Mexican patients. In addition, the presence of APOE ε4 allele and SORL1 variants could represent a genetic interaction effect that favors LOAD risk in the Mexican population. SNPs have been proposed as genetic markers associated with the development of LOAD that can support the clinical diagnosis. Future molecular studies could help understand sporadic Alzheimer’s Disease (AD) among the Mexican population, where currently there is a sub-estimate number in terms of disease frequency and incidence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,925

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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