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Enregistrement W4223416865 · doi:10.5489/cuaj.7775

The healthy urinary microbiome in asymptomatic participants in the MAPP Network Study: Relation to gender, age, and menopausal status

2022· article· en· W4223416865 sur OpenAlexaffvenue
J. Curtis Nickel, Alisa Stephens, Jennifer T. Anger, H. Henry Lai, Garth D. Ehrlich

Notice bibliographique

RevueCanadian Urological Association Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueUrinary Tract Infections Management
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAsymptomaticMicrobiomeUreaplasmaPhysiologyUrinary systemInternal medicineLactobacillusUrineMedicineBiologyImmunologyMicrobiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: To understand the role of the urinary microbiome in disease states and interpret non-culture-based diagnostic urine testing of midstream urine specimens, we must have a better understanding of the urinary microbiome in asymptomatic, healthy individuals. We examined the impact of gender, age, and menopausal status on the healthy human urinary microbiome in asymptomatic control subjects enrolled in the multi-institution National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) Multidisciplinary Approach to the Study of Chronic Pelvic Pain Network (MAPP) study. METHODS: Asymptomatic, healthy controls, recruited to be ageand sex-matched to patients in the Trans-MAPP Epidemiology and Phenotyping Study, provided midstream urine collection for polymerase chain reaction (PCR)-electrospray ionization mass spectrometry identification of urinary microbiota. The microbiomes of male and female participants were described and analyzed for differences in composition and diversity at the species and genus level by sex, age, and, in females, by menopausal status. RESULTS: Sixty-six total species were detected with a mean of 1.2 species (standard deviation [SD] 1.1) per male (n=97; mean age=43) and 2.3 (SD 1.3) per female (n=110, mean age=38) in asymptomatic, healthy controls. Species and genera diversity analyses showed significantly greater richness and diversity in females. With regard to species, Bifidobacterium subtile, Lactobacillus crispatus, and Lactobacillus johnsonii were more predominant in females. The genera Bifidobacterium, Staphylococcus, Lactobacillus, and Corynebacterium were more predominant in females, while for males the most prevalent organisms included Staphylococcus and Propionibacterium; only Propionibacterium approached a significant difference between genders. No significant difference in the presence and/or diversity of micro-organisms with menopausal status could be observed. Sex-specific age trends, particularly diversity, were larger for females than males. CONCLUSIONS: These results suggest the urinary microbiome of healthy, asymptomatic subjects differed between genders and age in females, but not menopausal status. Gender differences may be attributable to the detection of urethral/vaginal organisms in females and prostate organisms in males. These findings will better allow us to interpret the results of microbiome reports in the midstream urine specimens of patients with urinary symptoms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,703

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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