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Enregistrement W4223430425 · doi:10.3390/curroncol29040215

The Clinically Actionable Molecular Profile of Early versus Late-Stage Non-Small Cell Lung Cancer, an Individual Age and Sex Propensity-Matched Pair Analysis

2022· article· en· W4223430425 sur OpenAlexafffundvenue
Anna McGuire, Melissa K. McConechy, Barbara Melosky, John C. English, James J. Choi, Defen Peng, John Yee, Benjamin L. S. Furman, Rosalia Aguirre Hernandez, Pedro Feijão, David T. Mulder, Curtis Hughesman, Stephen Yip

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreVancouver Coastal Health Research InstituteCentre for Advancing Health OutcomesVancouver General HospitalVancouver Coastal Health
Organismes subventionnairesVancouver Coastal Health Research Institute
Mots-clésMedicinePropensity score matchingLung cancerStage (stratigraphy)OncologyInternal medicineBioinformaticsComputational biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Despite meticulous surgery for non-small cell lung cancer (NSCLC), relapse is as high as 70% at 5 years. Many institutions do not conduct reflexive molecular testing on early stage specimens, although targeted gene therapy may extend life by years in the event of recurrence. This ultimately delays definitive treatment with additional biopsy risking suboptimal tissue acquisition and quality for molecular testing. Objective: To compare molecular profiles of genetic alterations in early and late NSCLC to provide evidence that reflexive molecular testing provides clinically valuable information. Methods: A single-center propensity matched retrospective analysis was conducted using prospectively collected data. Adults with early and late-stage NSCLC had tissue subject to targeted panel-based NGS. Frequencies of putative drivers were compared, with 1:3 matching on the propensity score; p < 0.05 deemed statistically significant. Results: In total, 635 NSCLC patients underwent NGS (59 early, 576 late); 276 (43.5%) females; age 70.9 (±10.2) years; never smokers 140 (22.0%); 527 (83.0%) adenocarcinomas. Unadjusted frequencies of EGFR mutations were higher in the early cohort (30% vs. 18%). Following adjustment for sex and smoking status, similar frequencies for both early and late NSCLC were observed for variants in EGFR, KRAS, ALK, MET, and ROS1. Conclusion: The frequency of clinically actionable variants in early and late-stage NSCLC was found to be similar, providing evidence that molecular profiling should be performed on surgical specimens. This pre-determined profile is essential to avoid treatment delay for patients who will derive clinical benefit from targeted systemic therapy, in the high likelihood of subsequent relapse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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