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Enregistrement W4223475345 · doi:10.1111/odi.14206

Image collection and annotation platforms to establish a multi‐source database of oral lesions

2022· article· en· W4223475345 sur OpenAlexfundno aff
Senthilmani Rajendran, Jian Han Lim, Kohgulakuhan Yogalingam, Thomas George Kallarakkal, Rosnah Binti Zain, Ruwan Duminda Jayasinghe, Jyotsna Rimal, Alexander Ross Kerr, Rahmi Amtha, Karthikeya Patil, Roshan A. Welikala, Ying Zhi Lim, Paolo Remagnino, John Gibson, Wanninayake Mudiyanselage Tilakaratne, Chee Sun Liew, Yi‐Hsin Yang, Sarah Barman, Chee Seng Chan, Sok Ching Cheong

Notice bibliographique

RevueOral Diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversitas TrisaktiMedical Research Council CanadaUniversiti Malaya
Mots-clésAnnotationAutomatic image annotationReferralLesionMedicineUploadDatabaseComputer scienceInterface (matter)Image retrievalPathologyArtificial intelligenceWorld Wide WebImage (mathematics)Family medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective To describe the development of a platform for image collection and annotation that resulted in a multi‐sourced international image dataset of oral lesions to facilitate the development of automated lesion classification algorithms. Materials and Methods We developed a web‐interface, hosted on a web server to collect oral lesions images from international partners. Further, we developed a customised annotation tool, also a web‐interface for systematic annotation of images to build a rich clinically labelled dataset. We evaluated the sensitivities comparing referral decisions through the annotation process with the clinical diagnosis of the lesions. Results The image repository hosts 2474 images of oral lesions consisting of oral cancer, oral potentially malignant disorders and other oral lesions that were collected through MeMoSA ® UPLOAD. Eight‐hundred images were annotated by seven oral medicine specialists on MeMoSA ® ANNOTATE, to mark the lesion and to collect clinical labels. The sensitivity in referral decision for all lesions that required a referral for cancer management/surveillance was moderate to high depending on the type of lesion (64.3%–100%). Conclusion This is the first description of a database with clinically labelled oral lesions. This database could accelerate the improvement of AI algorithms that can promote the early detection of high‐risk oral lesions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0080,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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