MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4223508141 · doi:10.3390/cancers14081923

An Exploratory Study of Refining TNM-8 M1 Categories and Prognostic Subgroups Using Plasma EBV DNA for Previously Untreated De Novo Metastatic Nasopharyngeal Carcinoma

2022· article· en· W4223508141 sur OpenAlexaff
Sik-Kwan Chan, Brian O’Sullivan, Shao Hui Huang, Tin‐Ching Chau, Ka-On Lam, Sum‐Yin Chan, Chi‐Chung Tong, Varut Vardhanabhuti, Dora Lai‐Wan Kwong, Chor-Yi Ng, To‐Wai Leung, Mai‐Yee Luk, Anne W.M. Lee, Cheuk‐Wai Choi, Victor Lee

Notice bibliographique

RevueCancers · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesQueen Mary University of London
Mots-clésMedicineOncologyConcordanceInternal medicineNasopharyngeal carcinomaCohortStage (stratigraphy)Recursive partitioningRadiation therapyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(1) Background: NPC patients with de novo distant metastasis appears to be a heterogeneous group who demonstrate a wide range of survival, as suggested by growing evidence. Nevertheless, the current 8th edition of TNM staging (TNM-8) grouping all these patients into the M1 category is not able to identify their survival differences. We sought to identify any anatomic and non-anatomic subgroups in this study. (2) Methods: Sixty-nine patients with treatment-naive de novo M1 NPC (training cohort) were prospectively recruited from 2007 to 2018. We performed univariable and multivariable analyses (UVA and MVA) to explore anatomic distant metastasis factors, which were significantly prognostic of overall survival (OS). Recursive partitioning analysis (RPA) with the incorporation of significant factors from MVA was then performed to derive a new set of RPA stage groups with OS segregation (Set 1 Anatomic-RPA stage groups); another run of MVA was performed with the addition of pre-treatment plasma EBV DNA. A second-round RPA with significant prognostic factors of OS identified in this round of MVA was performed again to derive another set of stage groups (Set 2 Prognostic-RPA stage groups). Both sets were then validated externally with an independent validation cohort of 67 patients with distant relapses of their initially non-metastatic NPC (rM1) after radical treatment. The performance of models in survival segregation was evaluated by the Akaike information criterion (AIC) and concordance index (C-index) under 1000 bootstrapping samples for the validation cohort; (3) Results: The 3-year OS and median follow-up in the training cohort were 36.0% and 17.8 months, respectively. Co-existence of liver-bone metastases was the only significant prognostic factor of OS in the first round UVA and MVA. Set 1 RPA based on anatomic factors that subdivide the M1 category into two groups: M1a (absence of co-existing liver-bone metastases; median OS 28.1 months) and M1b (co-existing liver-bone metastases; median OS 19.2 months, p = 0.023). When pre-treatment plasma EBV DNA was also added, it became the only significant prognostic factor in UVA (p = 0.001) and MVA (p = 0.015), while co-existing liver-bone metastases was only significant in UVA. Set 2 RPA with the incorporation of pre-treatment plasma EBV DNA yielded good segregation (M1a: EBV DNA ≤ 2500 copies/mL and M1b: EBV DNA > 2500 copies/mL; median OS 44.2 and 19.7 months, respectively, p < 0.001). Set 2 Prognostic-RPA groups (AIC: 228.1 [95% CI: 194.8−251.8] is superior to Set 1 Anatomic-RPA groups (AIC: 278.5 [254.6−301.2]) in the OS prediction (p < 0.001). Set 2 RPA groups (C-index 0.59 [95% CI: 0.54−0.67]) also performed better prediction agreement in the validation cohort (vs. Set 1: C-index 0.47 [95% CI: 0.41−0.53]) (p < 0.001); (4) Conclusions: Our Anatomic-RPA stage groups yielded good segregation for de novo M1 NPC, and prognostication was further improved by incorporating plasma EBV DNA. These new RPA stage groups for M1 NPC can be applied to countries/regions regardless of whether reliable and sensitive plasma EBV DNA assays are available or not.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancersMême sujetHead and Neck Cancer StudiesTravaux en français237 207