Response of Plant-Associated Microbiome to Plant Root Colonization by Exogenous Bacterial Endophyte in Perennial Crops
Notice bibliographique
Résumé
The application of bacterial inoculums for improving plant growth and production is an important component of sustainable agriculture. However, the efficiency of perennial crop inoculums depends on the ability of the introduced endophytes to exert an impact on the host-plant over an extended period of time. This impact might be evaluated by the response of plant-associated microbiome to the inoculation. In this study, we monitored the effect of a single bacterial strain inoculation on the diversity, structure, and cooperation in plant-associated microbiome over 1-year period. An endophyte (RF67) isolated fromVaccinium angustifolium(wild blueberry) roots and annotated asRhizobiumwas used for the inoculation of 1-year-oldLonicera caerulea(Haskap) plants. A significant level of bacterial community perturbation was detected in plant roots after 3 months post-inoculation. About 23% of root-associated community variation was correlated with an application of the inoculant, which was accompanied by increased cooperation between taxa belonging to Proteobacteria and Actinobacteriota phyla and decreased cooperation between Firmicutes in plant roots. Additionally, a decrease in bacterial Shannon diversity and an increase in the relative abundances ofRhizobiaceaeandEnterobacteriaceaewere detected in the roots of inoculated plants relative to the non-inoculated control. A strong effect of the inoculation on the bacterial cooperation was also detected after 1 year of plant field growth, whereas no differences in bacterial community composition and also alpha and beta diversities were detected between bacterial communities from inoculated and non-inoculated roots. These findings suggest that while exogenous endophytes might have a short-term effect on the root microbiome structure and composition, they can boost cooperation between plant-growth-promoting endophytes, which can exist for the extended period of time providing the host-plant with long-lasting beneficial effects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».