Serine hydroxymethyltransferase 2 predicts unfavorable outcomes in multiple cancer: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Serine hydroxymethyltransferase (SHMT) is critical for one-carbon unit metabolism and is increasingly reported to be associated with tumor patients’ outcomes. Thus, we designed and performed this meta-analysis to reveal its prognostic role and relationship with clinicopathological characteristics in human cancer. Methods: A systematic search of PubMed, Embase, Web of Science and Cochrane Library (CENTRAL) was carried out. Two reviewers independently screened all references for eligibility according to the inclusion criteria. The Newcastle-Ottawa Quality Assessment Scale was used to assess the quality and data was extracted for the meta-analysis. Results: Ten studies, composed of 1,942 patients in total, were included in this meta-analysis. Higher expression of SHMT2 means an unfavorable prognosis [overall survival: hazard ratio (HR) =2.14, 95% confidence interval (CI): 1.53 to 2.99; progression-free survival (PFS)/disease-free survival (DFS)/recurrence-free survival (RFS): HR =1.90, 95% CI: 1.31 to 2.76]. Furthermore, higher SHMT2 expression is associated with larger tumor size [odds ratio (OR) =2.09, 95% CI: 1.58 to 2.77], more lymph node invasions [OR =2.67, 95% CI: 1.78 to 4.00), and higher tumor node metastasis classification (TNM) stage (OR =2.23, 95% CI: 1.55 to 3.21). Higher expression of SHMT2 is also related to higher histopathological grade (OR =3.46, 95% CI: 1.46 to 8.27) and distant metastasis (OR =1.25, 95% CI: 0.32 to 4.90), however, with significant heterogeneity (I2=61%, P=0.08 for distant metastasis; I2=82%, P<0.001 for histopathological grade). The prognostic clinical role of SHMT1 in clinical patients has not been directly investigated yet. Discussion: SHMT2 may serve as a promising prognostic biomarker in various cancer, especially in the alimentary system. Further large-scale studies are warranted to verify the possible effect.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».