Serine hydroxymethyltransferase 2 predicts unfavorable outcomes in multiple cancer: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: Serine hydroxymethyltransferase (SHMT) is critical for one-carbon unit metabolism and is increasingly reported to be associated with tumor patients’ outcomes. Thus, we designed and performed this meta-analysis to reveal its prognostic role and relationship with clinicopathological characteristics in human cancer. Methods: A systematic search of PubMed, Embase, Web of Science and Cochrane Library (CENTRAL) was carried out. Two reviewers independently screened all references for eligibility according to the inclusion criteria. The Newcastle-Ottawa Quality Assessment Scale was used to assess the quality and data was extracted for the meta-analysis. Results: Ten studies, composed of 1,942 patients in total, were included in this meta-analysis. Higher expression of SHMT2 means an unfavorable prognosis [overall survival: hazard ratio (HR) =2.14, 95% confidence interval (CI): 1.53 to 2.99; progression-free survival (PFS)/disease-free survival (DFS)/recurrence-free survival (RFS): HR =1.90, 95% CI: 1.31 to 2.76]. Furthermore, higher SHMT2 expression is associated with larger tumor size [odds ratio (OR) =2.09, 95% CI: 1.58 to 2.77], more lymph node invasions [OR =2.67, 95% CI: 1.78 to 4.00), and higher tumor node metastasis classification (TNM) stage (OR =2.23, 95% CI: 1.55 to 3.21). Higher expression of SHMT2 is also related to higher histopathological grade (OR =3.46, 95% CI: 1.46 to 8.27) and distant metastasis (OR =1.25, 95% CI: 0.32 to 4.90), however, with significant heterogeneity (I2=61%, P=0.08 for distant metastasis; I2=82%, P<0.001 for histopathological grade). The prognostic clinical role of SHMT1 in clinical patients has not been directly investigated yet. Discussion: SHMT2 may serve as a promising prognostic biomarker in various cancer, especially in the alimentary system. Further large-scale studies are warranted to verify the possible effect.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,016 | 0,039 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».