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Enregistrement W4223551946 · doi:10.1038/s41598-022-09778-6

PACE4-altCT isoform of proprotein convertase PACE4 as tissue and plasmatic biomarker for prostate cancer

2022· article· en· W4223551946 sur OpenAlexafffund
Frédéric Couture, Luojun Wang, Frédérik Dufour, Keena Chabot-Maheux, Nadia Ekindi Ndongo, Robert Sabbagh, Robert Day

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensAptose Biosciences (Canada)Université de SherbrookeOncolytics Biotech (Canada)
Organismes subventionnairesInstitut sur la Nutrition et les Aliments FonctionnelsCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésProstate cancerImmunohistochemistryBiomarkerLNCaPGene isoformCancerProstateCancer researchMedicineProprotein ConvertasesPCA3Internal medicinePathologyBiologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The proprotein convertase PACE4 has demonstrated value as a viable therapeutic target in prostate cancer (PCa). A novel isoform named PACE4-altCT, which arises in neoplastic lesions, plays an important role in tumor progression and has been validated as a pharmacological target. With the discovery of its overexpression in PCa and the alternative splicing of its pre-RNA to generate an oncogenic C-terminally modified isoform named PACE4-altCT, understanding and validating its value as a potential biomarker is of great interest either from prognostic or targeted therapy intervention. Expression of ERG in LNCaP cells was used to investigate the relationship between ERG expression occurring in PCa cells and PACE4-altCT expression by Western blot and qPCR. Using immunohistochemistry, the expression levels of PACE4 isoforms in patient tissues were investigated and correlated with ERG tumor status and Gleason score. An ELISA method was developed using affinity purified recombinant protein and used for quantitative analysis of plasma concentrations of PACE4-altCT and used for correlation. In contrast with the consensual isoform, PACE4-altCT was only strongly overexpressed in prostate cancer patients, correlated with ERG expression levels. Despite its intracellular retention PACE4-altCT could be detected in the plasma of most patients with prostate cancer, whereas it was only found at low levels in normal patients whereas total plasmatic PACE4 levels did not vary significantly between groups. Our study demonstrates that PACE4-altCT is strongly overexpressed in prostate cancer using both immunohistochemical and ELISA techniques and may have some interesting potential as a biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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