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Enregistrement W4223911045 · doi:10.1093/femsec/fiac045

Hiding in plain sight—wildlife as a neglected reservoir and pathway for the spread of antimicrobial resistance: a narrative review

2022· review· en· W4223911045 sur OpenAlexfundno aff
Mohamed Salah Abbassi, Souhir Badi, Sana Lengliz, Riadh Mansouri, Salah Hammami, Paul Hynds

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Ecology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePharmaceutical and Antibiotic Environmental Impacts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Higher Education and Scientific ResearchMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésBiologyEcological nicheAntibiotic resistanceUrbanizationEcologyWildlifeAntimicrobialResistance (ecology)BiotechnologyHabitatBacteriaMicrobiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antimicrobial resistance represents a global health problem, with infections due to pathogenic antimicrobial resistant bacteria (ARB) predicted to be the most frequent cause of human mortality by 2050. The phenomenon of antimicrobial resistance has spread to and across all ecological niches, and particularly in livestock used for food production with antimicrobials consumed in high volumes. Similarly, hospitals and other healthcare facilities are recognized as significant 'hotspots' of ARB and antimicrobial resistance genes (ARGs); however, over the past decade, new and previously overlooked ecological niches are emerging as hidden reservoirs of ARB/ARGs. Increasingly extensive and intensive industrial activities, degradation of natural environments, burgeoning food requirements, urbanization, and global climatic change have all dramatically affected the evolution and proliferation of ARB/ARGs, which now stand at extremely concerning ecological levels. While antimicrobial resistant bacteria and genes as they originate and emanate from livestock and human hosts have been extensively studied over the past 30 years, numerous ecological niches have received considerably less attention. In the current descriptive review, the authors have sought to highlight the importance of wildlife as sources/reservoirs, pathways and receptors of ARB/ARGs in the environment, thus paving the way for future primary research in these areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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