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Enregistrement W4223938672 · doi:10.1101/2022.03.31.22273208

COVID-19 in people with neurofibromatosis 1, neurofibromatosis 2, or schwannomatosis

2022· preprint· en· W4223938672 sur OpenAlexaff
Jineta Banerjee, Jan M. Friedman, Laura J. Klesse, Kaleb Yohay, Justin T. Jordan, Scott R. Plotkin, Robert J. Allaway, Jaishri O. Blakeley

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesYale Center for Clinical Investigation, Yale School of MedicineNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesClinical and Translational Science Center, University of New MexicoClinical and Translational Science Institute, Boston UniversitySouth Carolina Clinical and Translational Research Institute, Medical University of South CarolinaCenter for Clinical and Translational Sciences, University of Texas Health Science Center at HoustonInstitute for Integration of Medicine and ScienceCenter for Clinical and Translational Science, Mayo ClinicColorado Clinical and Translational Sciences InstituteCenter for Clinical and Translational Science, University of MassachusettsUniversity of Colorado DenverLeonard M. Miller School of MedicineUniversity of California, IrvineOregon Clinical and Translational Research InstituteWeill Cornell Medical CollegeUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignUniversity of Oklahoma Health Sciences CenterNational Institutes of HealthStony Brook UniversityOchsner HealthLouisiana Clinical and Translational Science CenterPenn State Clinical and Translational Science InstituteGeorgia Clinical and Translational Science AllianceChildren's National HospitalUniversity of Arkansas for Medical SciencesVanderbilt University Medical CenterTranslational Research Institute, University of Arkansas for Medical SciencesNorthShore University HealthSystemSouthern California Clinical and Translational Science InstituteUniversity of North Carolina at Chapel HillChildren’s Hospital of Wisconsin Research InstituteUniversity of MiamiUniversity of South CarolinaWest Virginia UniversityCarilion ClinicRutgers, The State University of New JerseyInstitute for Clinical and Translational Research, University of Wisconsin, MadisonPennsylvania State UniversityVanderbilt Institute for Clinical and Translational ResearchUniversity of CincinnatiInstitute of Clinical and Translational SciencesWake Forest Clinical and Translational Science Institute, Wake Forest School of MedicineInstitute for Translational Medicine and TherapeuticsUniversity of Texas Health Science Center at HoustonUniversity of Southern CaliforniaHarvard CatalystUniversity of OklahomaWashington University in St. LouisUniversity of MichiganUniversity of MinnesotaJohns Hopkins UniversityUniversity of WashingtonMichigan Institute for Clinical and Health ResearchUniversity of UtahChildren's Hospital of PhiladelphiaUniversity of PennsylvaniaGeorge Washington UniversityUniversity at BuffaloUniversity of RochesterNorthwestern UniversityVanderbilt UniversityAccelerated Innovation Research Initiative Turning Top Science and Ideas into High-Impact ValuesUniversity of ChicagoVirginia Commonwealth UniversityTulane UniversityBrown UniversityRush UniversityCincinnati Children's Hospital Medical CenterUniversity of Wisconsin-MadisonYale UniversityCenter for Clinical and Translational ResearchEmory UniversityUniversity of Texas Medical BranchWest Virginia Clinical and Translational Science InstituteUniversity of Nebraska Medical CenterChildren's Hospital ColoradoInstitute of Translational Health SciencesTufts Medical CenterFrontiers Clinical and Translational Science Institute, University of KansasUniversity of Texas Health Science Center at San AntonioLoyola University ChicagoWake Forest UniversityOhio State University
Mots-clésMedicineCohortCoronavirus disease 2019 (COVID-19)NeurofibromatosisSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)DiseasePopulationCohort studyInternal medicinePediatricsPathologyEnvironmental healthInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Purpose People with pre-existing conditions may be more susceptible to severe Coronavirus disease 2019 (COVID-19) when infected by severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2). The relative risk and severity of SARS-CoV-2 infection in people with rare diseases like neurofibromatosis (NF) type 1 (NF1), neurofibromatosis type 2 (NF2), or schwannomatosis (SWN) is unknown. Methods We investigated the proportions of SARS-CoV-2 positive or COVID-19 patients in people with NF1, NF2, or SWN in the National COVID Collaborative Cohort (N3C) electronic health record dataset. Results The cohort sizes in N3C were 2,501 (NF1), 665 (NF2), and 762 (SWN). We compared these to N3C cohorts of other rare disease patients (98 - 9844 individuals) and the general non-NF population of 5.6 million. The site- and age-adjusted proportion of people with NF1, NF2, or SWN who tested positive for SARS-CoV-2 or were COVID-19 patients (collectively termed positive cases ) was not significantly higher than in individuals without NF or other selected rare diseases. There were no severe outcomes reported in the NF2 or SWN cohorts. The proportion of patients experiencing severe outcomes was no greater for people with NF1 than in cohorts with other rare diseases or the general population. Conclusion Having NF1, NF2, or SWN does not appear to increase the risk of being SARS-CoV-2 positive or of being a COVID-19 patient, or of developing severe complications from SARS-CoV-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,066

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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