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Enregistrement W4223995279 · doi:10.1038/s41598-022-10270-4

Impaired surface marker expression in stimulated Epstein-Barr virus transformed lymphoblasts from Barth Syndrome patients

2022· article· en· W4223995279 sur OpenAlexafffund
Hana M. Zegallai, Grant M. Hatch

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésLymphoblastEpstein–Barr virusVirusVirologyBiologyMolecular biologyMedicineGeneticsCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Primary B lymphocytes rapidly respond to lipopolysaccharide (LPS) and cytosine linked to a guanine by a phosphate bond deoxyribonucleic acid (CpG DNA) stimulation to promote adaptive immune function through increased surface marker expression. Here we examined expression of surface markers in LPS and CpG DNA stimulated Epstein-Barr virus transformed B lymphoblasts from control and BTHS patients with different mutations. The percentage of cluster of differentiation (CD) positive cells including CD38 + , CD138 + , CD80 + surface expression and programmed cell death protein 1 (PD1 +) surface expression was similar between control and BTHS lymphoblasts incubated plus or minus LPS. The percentage of CD24 + , CD38 + and CD138 + cells was similar between control and BTHS lymphoblasts incubated plus or minus CpG DNA. CD27 + surface marker expression was reduced in both BTHS lymphoblasts and controls incubated with CpG DNA and PD1 + surface marker expression was higher in BTHS cells compared to controls but was unaltered by CpG DNA treatment. Thus, Epstein-Barr virus transformed control and BTHS lymphoblasts fail to increase selected surface markers upon stimulation with LPS and exhibit variable surface marker expression upon stimulation with CpG DNA. Since B lymphocyte surface marker expression upon activation is involved in B cell proliferation and differentiation, cell-cell interaction and the adaptive immune response, we suggest that caution should be exercised when interpreting immunological data obtained from Epstein-Barr virus transformed BTHS cells. Based upon our observations in control cells, our conclusions may be more broadly applicable to other diseases which utilize transformed B lymphocytes for the study of immune biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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