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Enregistrement W4224213480 · doi:10.1038/s43856-022-00107-6

Automated bone marrow cytology using deep learning to generate a histogram of cell types

2022· article· en· W4224213480 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCommunications Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueDigital Imaging for Blood Diseases
Établissements canadiensJuravinski HospitalMcMaster UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBone marrowCytologyHistogramHematologyPathologyMedicineArtificial intelligenceComputer scienceInternal medicineImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Bone marrow cytology is required to make a hematological diagnosis, influencing critical clinical decision points in hematology. However, bone marrow cytology is tedious, limited to experienced reference centers and associated with inter-observer variability. This may lead to a delayed or incorrect diagnosis, leaving an unmet need for innovative supporting technologies. Methods: We develop an end-to-end deep learning-based system for automated bone marrow cytology. Starting with a bone marrow aspirate digital whole slide image, our system rapidly and automatically detects suitable regions for cytology, and subsequently identifies and classifies all bone marrow cells in each region. This collective cytomorphological information is captured in a representation called Histogram of Cell Types (HCT) quantifying bone marrow cell class probability distribution and acting as a cytological patient fingerprint. Results: Our system achieves high accuracy in region detection (0.97 accuracy and 0.99 ROC AUC), and cell detection and cell classification (0.75 mean average precision, 0.78 average F1-score, Log-average miss rate of 0.31). Conclusions: HCT has potential to eventually support more efficient and accurate diagnosis in hematology, supporting AI-enabled computational pathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,784
Score d'incertitude au seuil0,397

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle