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Enregistrement W4224233487 · doi:10.1200/po.21.00450

Common Variant in ALDH2 Modifies the Risk of Breast Cancer Among Carriers of the p.K3326* Variant in BRCA2

2022· article· en· W4224233487 sur OpenAlexaff
Wojciech Kluźniak, Agata Szymiczek, Amélie Rodrigue, Dominika Wokołorczyk, Bogna Rusak, Klaudia Stempa, Tomasz Huzarski, Jacek Gronwald, Jan Lubiński, Neda Zamani, Shiyu Zhang, Jean‐Yves Masson, Steven A. Narod, Cezary Cybulski, Mohammad R. Akbari

Notice bibliographique

RevueJCO Precision Oncology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalPublic Health OntarioWomen's College HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésALDH2Breast cancerPenetranceAlleleGenotypeOdds ratioCancerAldehyde dehydrogenaseOncologyInternal medicineGeneticsMedicineCancer researchBiologyGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE The BRCA2 p.K3326* variant is considered a low-penetrance variant for breast cancer. Aldehydes that accumulate in cells under insufficient aldehyde oxidation were most recently shown to trigger carcinogenesis by promoting depletion of BRCA2 protein. Allele T of the common variant rs10744777 in the ALDH2 gene was associated with reduced expression of aldehyde dehydrogenase, the main enzyme in aldehyde oxidation. We hypothesized that this allele could modify breast cancer risk in women with the BRCA2 p.K3326* low-penetrance variant through reduced function of ALDH2, increased accumulation of cellular aldehydes, and depletion of BRCA2 protein. MATERIALS AND METHODS We genotyped 11,873 Polish women diagnosed with breast cancer and 7,615 ethnically matched controls for these two variants. Next, we extended our analysis of rs10744777 to 231 carriers of pathogenic BRCA2 mutations. RESULTS BRCA2 p.K3326* variant was associated with significant increase in breast cancer risk only in those who were homozygous for the T allele of the ALDH2 rs10744777 variant (odds ratio = 1.72; 95% CI, 1.19 to 2.48; P = .003). The BRCA2 p.K3326* variant did not increase the risk of breast cancer among those who were heterozygous or homozygous for the C allele of the ALDH2 rs10744777 variant (odds ratio = 1.05; 95% CI, 0.73 to 1.51; P = .81). In the carriers of high-risk BRCA2 mutations, the TT genotype of rs10744777 conferred a modest (18%) and not significant increase in breast cancer risk. CONCLUSION Our results suggest that BRCA2 p.K3326* variant, which is low-penetrance by itself, confers increased breast cancer risk on the background of the TT genotype of the ALDH2 rs10744777 variant in the Polish population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,541
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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