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Enregistrement W4224239632 · doi:10.1016/j.ekir.2022.04.013

ACLY and CKD: A Mendelian Randomization Analysis

2022· article· en· W4224239632 sur OpenAlexafffund
Pedrum Mohammadi‐Shemirani, Michael Chong, Nicolas Perrot, Marie Pigeyre, Gregory R. Steinberg, Guillaume Paré, Joan C. Krepinsky, Matthew B. Lanktree

Notice bibliographique

RevueKidney International Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonImpactThrombosis and Atherosclerosis Research InstitutePopulation Health Research InstituteMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchEsperion TherapeuticsMedical Research CouncilNovo NordiskKidney Foundation of CanadaCanadian Society of NephrologyDiabetes Canada
Mots-clésMedicineMendelian randomizationKidney diseaseInternal medicineRenal functionEndocrinologyBioinformaticsGeneticsBiologyGenotypeGeneGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Adenosine triphosphate-citrate lyase (ACLY) inhibition is a therapeutic strategy under investigation for atherosclerotic cardiovascular disease, nonalcoholic steatohepatitis, and metabolic syndrome. Mouse models suggest that ACLY inhibition could reduce inflammation and kidney fibrosis. Genetic analysis of ACLY in chronic kidney disease (CKD) has not been performed. Methods We constructed a genetic instrument by selecting variants associated with ACLY expression in the expression quantitative trait loci genetics consortium (eQTLGen) from blood samples from 31,684 participants. In a 2-sample Mendelian randomization analysis, we evaluated the effect of genetically predicted ACLY expression on the risk of CKD, estimated glomerular filtration rate (eGFR), and albumin-to-creatinine ratio (ACR) using the CKD Genetics (CKDGen) consortium, UK Biobank, and the Finnish Genetics (FinnGen) consortium totaling 66,396 CKD cases and 958,517 controls. Results ACLY is constitutively expressed in all cell types including in whole blood. The genetic instrument included 13 variants and explained 1.5% of the variation in whole blood ACLY gene expression. A 34% reduction in ACLY expression score was associated with a 0.04 mmol/l reduced low-density lipoprotein (LDL) cholesterol ( P = 3.4 × 10 −4 ) and a 9% reduced risk of CKD (stages 3, 4, 5, dialysis, or eGFR < 60 ml/min per 1.73 m 2 ) (odds ratio [OR] = 0.91, 95% CI: 0.85–0.98, P = 0.008), but no association was observed with either eGFR or ACR. Conclusion Mendelian randomization analyses revealed that genetically reduced ACLY expression was associated with reduced risk of CKD but had no effect on either eGFR or ACR. Further evaluation of ACLY in kidney disease is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,057
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,065
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0570,065
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0070,009
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0040,002
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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