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Enregistrement W4224248522 · doi:10.1088/2515-7620/ac693a

CrAssphage as an indicator of groundwater-borne pollution in coastal ecosystems

2022· article· en· W4224248522 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Research Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGroundwater and Isotope Geochemistry
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésSubmarine groundwater dischargeEnvironmental scienceGroundwaterPollutionIndicator bacteriaSewageSurface waterWater qualityHydrology (agriculture)PopulationFecal coliformEcologyAquiferEnvironmental engineeringGeologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Novel approaches for monitoring coastal water quality changes and identifying associated contaminant source(s) are of growing importance as climate change and population redistribution to coastal zones continue to impact coastal systems. CrAssphage, a virus found in the human gut and shed with fecal matter, is currently gaining popularity as an indicator of human fecal contamination in surface water and groundwater. Here we demonstrate that DNA assays targeting crAssphage genetic fragments can be used to detect pollution from nearshore onsite wastewater treatment systems discharging to the ocean via submarine groundwater discharge. We integrated this novel viral monitoring tool into a field study that characterized the physical hydrogeology (hydraulic gradients, hydraulic conductivity, and seepage fluxes) and surface water and groundwater quality at a study site on the north shore of Nova Scotia, Canada. Increased use of onsite wastewater treatment systems during the summer cottage season coincided with widespread detections of crAssphage in submarine groundwater discharge (4/4 samples) and coastal surface waters (3/8 samples). Conversely, classical fecal pollution indicators based on bacterial targets ( Escherichia coli and human-specific Bacteroidales genetic marker (HF183)) were sparsely detected in the samples in the coastal environment (2/12 E. coli samples, 0/12 HF183 samples), likely due to greater attenuation of bacterial contaminants within the subsurface environments. Results from this first application of crAssphage in coastal groundwater contribute to a growing body of research reporting the application of this emerging tracer in various environments impacted by sewage pollution sources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle