Subsurface Microbial Community Composition in Anchialine Environments Is Influenced by Original Organic Carbon Source at Time of Deposition
Notice bibliographique
Résumé
Prokaryotes constitute the majority of sedimentary biomass, where they cycle organic carbon and regulate organic matter transformation. The microbes inhabiting sediment are diverse and the factors controlling microbial community composition are not fully understood. Here, we characterized the prokaryotic community using 16S rRNA gene sequencing in 24 stratigraphic layers within a 89 cm (dated to ~1900 years old) sediment core from an anchialine sinkhole in the Bahamas with a stratified water column and anoxic bottom water. The microbial community was dominated by members of the Alphaproteobacteria, Dehalococcoidia, Gammaproteobacteria, Bathyarchaeota, and Campylobacter classes. Most interestingly, subsurface microbial community structure could be correlated to previous evidence for timewise changes in the main source of organic matter that was supplied to the sediment accumulating during the last 2000 years, which itself was caused by regional terrestrial vegetation changes. The C:N ratio was correlated to the relative abundance of the microbial classes, and the microbial communities followed three previously determined time periods based on the source of organic matter, which suggests that the carbon source at time of deposition influences the resultant subsurface microbial community composition. These results show that carbon source is a driver of the microbial community composition inhabiting anoxic sediment, which could have implications for improving understanding of carbon cycling in coastal sedimentary basins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».