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Enregistrement W4224281600 · doi:10.1016/j.mex.2022.101693

So, you want to create a frog cell line? A guide to establishing frog skin cell lines from tissue explants

2022· article· en· W4224281600 sur OpenAlexafffund
Maxwell P. Bui-Marinos, Lauren A. Todd, Alexander J. Douglas, Barbara A. Katzenback

Notice bibliographique

RevueMethodsX · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Waterloo
Mots-clésAmphibianExplant cultureBiologyXenopusCell biologyCell cultureIn vivoTissue cultureIn vitroAfrican clawed frogEcologyBiotechnologyBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skin is an important interface with the external environment and investigating amphibian skin cell biology will improve our understanding of how environmental factors such as pathogens and pollutants are contributing to global amphibian declines. There is a critical need for in vitro systems to facilitate conservation research in model and non-model amphibians and the creation of new amphibian cell lines will play a significant role in reducing or even replacing the use of live animals for in vivo studies by providing an in vitro alternative. Here, we detail an adapted protocol for the generation of spontaneously arising cell lines from frog skin tissues, without the need for immortalization steps. Expanding the amphibian invitrome will foster and expedite new research in amphibian gene function, cellular responses, host-pathogen interactions, and toxicology. The following customizations to traditional tissue explant generation procedures have facilitated the successful generation of adherent skin epithelial-like cell lines from Xenopus laevis and can be further adapted for use with different frog species, such as Rana sylvatica, and different tissues: Osmotic adjustment of culture medium and solutions for different amphibian species. Use of small tissue explants, instead of enzymatic digestion of tissues, and gentle spotting of these tissue explants onto the growth surface of tissue culture flasks to promote better tissue adherence. Partial replacement of medium to allow accumulation of potential endogenous growth factors in cultures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,095

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,031

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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