Addressing the role of PKD3 in the T cell compartment with knockout mice
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The Protein kinase D3 (PKD3) has been implicated in signal transduction downstream of the T cell receptor (TCR). However, its role for the activation of primary T lymphocytes has not been elucidated so far. Methods Expression of PKD isoforms in primary murine T cells was determined by RT-PCR and SDS-Page. A germline PKD3-knockout mouse line was analyzed for its immune response to OVA/alum intraperitoneal immunization. Phenotyping of the T cell compartment ex vivo as well as upon stimulation in vitro was performed by flow cytometry. Additionally, cytokine expression was assessed by flow cytometry, RT-PCR and Luminex technology. Results PKD expression in T cells is modulated by TCR stimulation, leading to a rapid down-regulation on mRNA and on protein level. PKD3-deficient mice respond to immunization with enhanced T follicular helper cell generation. Furthermore, peripheral PKD3-deficient CD4+ T cells express more interleukin-2 than wild type CD4+ T cells upon TCR stimulation ex vivo. However, purified naïve CD4+ T cells do not differ in their phenotype upon differentiation in vitro from wild type T cells. Moreover, we observed a shift towards an effector/memory phenotype of splenic T cells at steady state, which might explain the contradictory results obtained with pan-T cells ex vivo and naïve-sorted T cells. Conclusion While PKD3-deficiency in vivo in mice leads to a skewing of the T cell compartment towards a more activated phenotype, this kinase seems to be dispensable for naïve CD4+ T cell differentiation in vitro.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».