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Enregistrement W4224307136 · doi:10.1084/jem.20212427

Life-threatening viral disease in a novel form of autosomal recessive <i>IFNAR2</i> deficiency in the Arctic

2022· article· en· W4224307136 sur OpenAlexaffabout
C.J. Duncan, Morten Kelder Skouboe, Sophie Howarth, Anne Kruse Hollensen, Rui Chen, Malene Landbo Børresen, Benjamin Thompson, Jarmila Stremenova Spegarova, Catherine F. Hatton, Frederik Filip Stæger, Mette K. Andersen, John Whittaker, Søren R. Paludan, Sofie E. Jørgensen, Martin K. Thomsen, Jacob Giehm Mikkelsen, Carsten Heilmann, Daniela Buhaş, Nina Friesgaard Øbro, Jakob Thaning Bay, Hanne Vibeke Marquart, M. Teresa de la Morena, Joseph Klejka, Matthew Hirschfeld, Line Borgwardt, Isabel Forss, Tania Nicole Masmas, Anja Poulsen, Francisco Noya, Guy A. Rouleau, Torben Hansen, Sirui Zhou, Anders Albrechtsen, Reza Alizadehfar, Eric J. Allenspach, Sophie Hambleton, Trine H. Mogensen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMontreal General HospitalMontreal Children's HospitalMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesDanmarks Frie ForskningsfondNovo Nordisk FondenMedical Research CouncilNovo NordiskAarhus UniversitetSteno Diabetes Center CopenhagenH. Lundbeck A/SSyddansk UniversitetLundbeckfondenWellcome TrustCSL Behring
Mots-clésDiseaseGeneticsThe arcticArcticBiologyMedicineInternal medicineEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type I interferons (IFN-I) play a critical role in human antiviral immunity, as demonstrated by the exceptionally rare deleterious variants of IFNAR1 or IFNAR2. We investigated five children from Greenland, Canada, and Alaska presenting with viral diseases, including life-threatening COVID-19 or influenza, in addition to meningoencephalitis and/or hemophagocytic lymphohistiocytosis following live-attenuated viral vaccination. The affected individuals bore the same homozygous IFNAR2 c.157T>C, p.Ser53Pro missense variant. Although absent from reference databases, p.Ser53Pro occurred with a minor allele frequency of 0.034 in their Inuit ancestry. The serine to proline substitution prevented cell surface expression of IFNAR2 protein, small amounts of which persisted intracellularly in an aberrantly glycosylated state. Cells exclusively expressing the p.Ser53Pro variant lacked responses to recombinant IFN-I and displayed heightened vulnerability to multiple viruses in vitro-a phenotype rescued by wild-type IFNAR2 complementation. This novel form of autosomal recessive IFNAR2 deficiency reinforces the essential role of IFN-I in viral immunity. Further studies are warranted to assess the need for population screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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