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Enregistrement W4224313858 · doi:10.9758/cpn.2022.20.2.211

Potential Candidates for Biomarkers in Bipolar Disorder: A Proteomic Approach through Systems Biology

2022· review· en· W4224313858 sur OpenAlexaff
Paola Rampelotto Ziani, Jacson Gabriel Feiten, Jéferson Ferraz Goularte, Rafael Colombo, Bárbara Antqueviezc, Luíza Paul Géa, Adriane Ribeiro Rosa

Notice bibliographique

RevueClinical Psychopharmacology and Neuroscience · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesFundação Instituto de Pesquisas EconômicasFundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul
Mots-clésBipolar disorderBiomarkerComputational biologyProteomicsProteomeBiomarker discoveryBioinformaticsDiseaseSystems biologyBiologyMedicineNeuroscienceCognitionGeneticsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder (BD) is one of the most disabling diseases characterized by severe humor fluctuation. It is accompanied by cognitive and functional impairment in addiction to high suicide rates. BD is often underdiagnosed and treated incorrectly because many of the reported symptoms are not exclusive to the disorder. Once the diagnosis is exclusively clinical, it is not possible to state precisely. From that, proteomic approaches were used to identify, in a large scale, all proteins involved in cellular or tissue processes. This review aggregate data from blood proteomes, by using protein association network, of subjects with BD and healthy controls to suggest dysfunctional molecular pathways involved in disease. Original articles containing proteomic analysis were searched in PubMed. Seven studies were selected and data were extracted for posterior analysis. A protein-protein interaction network was created by STRING database. A final set of proteins in this network were employed as input in ClueGO and, the main biological process was visualized using R package pathview. The analysis revealed proteins associated with many biological processes, including growth and endocrine regulation, iron transportation, protease inhibition, protection against pathogens and cholesterol transport. Moreover, pathway analysis indicated the association of uncovered proteins with two main metabolic pathways: complement system and coagulation cascade. Thus, a better understanding on the pathophysiology of psychiatric disorders and the identification of potential biomarker candidates are essential to improve diagnostic, prognostic and design pharmacological strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,354 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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