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Enregistrement W4224938342 · doi:10.3389/fnagi.2022.787516

Modeling the Properties of White Matter Tracts Using Diffusion Tensor Imaging to Characterize Patterns of Injury in Aging and Neurodegenerative Disease

2022· article· en· W4224938342 sur OpenAlexfundno aff
Chun Yen Kok, Christine Lock, Ting Yao Ang, Nicole C. Keong

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Aging Neuroscience · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Medical Research CouncilNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaMeso Scale DiagnosticsMedical Research CouncilEli Lilly and CompanyU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationBristol-Myers SquibbAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésDiffusion MRIWhite matterVentriculomegalyTractographyAtlas (anatomy)Internal capsuleMagnetic resonance imagingNeuroimagingNeuroscienceMedicinePsychologyRadiologyAnatomyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diffusion tensor imaging (DTI) is a relatively novel magnetic resonance-based imaging methodology that can provide valuable insight into the microstructure of white matter tracts of the brain. In this paper, we evaluated the reliability and reproducibility of deriving a semi-automated pseudo-atlas DTI tractography method vs. standard atlas-based analysis alternatives, for use in clinical cohorts with neurodegeneration and ventriculomegaly. We showed that the semi-automated pseudo-atlas DTI tractography method was reliable and reproducible across different cohorts, generating 97.7% of all tracts. However, DTI metrics obtained from both methods were significantly different across the majority of cohorts and white matter tracts (p < 0.001). Despite this, we showed that both methods produced patterns of white matter injury that are consistent with findings reported in the literature and with DTI profiles generated from these methodologies. Scatter plots comparing DTI metrics obtained from each methodology showed that the pseudo-atlas method produced metrics that implied a more preserved neural structure compared to its counterpart. When comparing DTI metrics against a measure of ventriculomegaly (i.e., Evans’ Index), we showed that the standard atlas-based method was able to detect decreasing white matter integrity with increasing ventriculomegaly, while in contrast, metrics obtained using the pseudo-atlas method were sensitive for stretch or compression in the posterior limb of the internal capsule. Additionally, both methods were able to show an increase in white matter disruption with increasing ventriculomegaly, with the pseudo-atlas method showing less variability and more specificity to changes in white matter tracts near to the ventricles. In this study, we found that there was no true gold-standard for DTI methodologies or atlases. Whilst there was no congruence between absolute values from DTI metrics, differing DTI methodologies were still valid but must be appreciated to be variably sensitive to different changes within white matter injury occurring concurrently. By combining both atlas and pseudo-atlas based methodologies with DTI profiles, it was possible to navigate past such challenges to describe white matter injury changes in the context of confounders, such as neurodegenerative disease and ventricular enlargement, with transparency and consistency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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