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Enregistrement W4224949081 · doi:10.1111/tme.12866

Diagnostic accuracy of Abbott Architect Assay as a screening tool for human T‐cell leukaemia virus type‐1 and type‐2 infection in a London teaching hospital with a large solid organ transplant centre

2022· article· en· W4224949081 sur OpenAlexaff
Nathaniel Lee, Jamie Murphy, Rasheed Al‐Khudairi, Ann Sturdy, Tabitha Mahungu, Tanzina Haque, Paul Griffiths, Jennifer Tosswill, Dianne Irish

Notice bibliographique

RevueTransfusion Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerologyMedicineAntibodyVirologyImmunologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: In the United Kingdom, organ donors/recipients are screened for evidence of human T-cell leukaemia virus type-1 and type-2 (HTLV-1/2) infections. Since the United Kingdom is a low prevalence country for HTLV infections, a screening assay with high sensitivity and specificity is required. Samples with repeat reactivity on antibody testing are sent to a reference lab for confirmatory serological and molecular testing. In the case of donor screen, this leads to delays in the release of organs and can result in wastage. We aim to assess whether a signal/cut-off (S/CO) ratio higher than the manufacturer's recommendation of 1.0 in the Abbott Architect antibody assay is a reliable measure of HTLV-1/2 infection. METHODS: We conducted a 5 year retrospective analysis of 7245 patients from which 11 766 samples were tested on the Abbott Architect rHTLV I/II assay. Reactive samples (S/CO >1) were referred for confirmatory serological and molecular detection (Western Blot and proviral DNA) at UK Health Security Agency, (formerly PHE, Colindale), the national reference laboratory. Electronic, protected laboratory and hospital patient databases were employed to collate data. RESULTS: A total of 45 patients had initially reactive samples. 42.2% (n = 19/45) had an S/CO ratio > 20, with HTLV infection confirmed in n = 18/19 and indeterminate confirmatory results in n = 1/19. No samples with an S/CO ratio <4 (48.9%, n = 22/45) or 4-20 (8.9%, n = 4/45) had positive confirmatory results on subsequent confirmatory testing. CONCLUSION: Samples with an S/CO >20 likely represent a true HTLV-1/2 infection. Reactive samples with an S/CO <4 were unlikely to confirm for HTLV infections. Interpretation of these ratios can assist clinicians in the assessment of low reactive samples and reiterates the need for faster access to confirmatory testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,493
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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