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Enregistrement W4224987353 · doi:10.2460/javma.21.12.0541

ATP7A, ATP7B, and RETN genotypes in Labrador Retrievers with and without copper-associated hepatopathy

2022· article· en· W4224987353 sur OpenAlexaboutno aff
Daniel K. Langlois, Brendan S. M. Nagler, Rebecca C. Smedley, Ya-Ting Yang, Vilma Yuzbasiyan‐Gurkan

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Veterinary Medical Association · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeATP7AMedicineGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To determine the frequency of previously reported coding variants in the ATP7A, ATP7B, and RETN genes in a US population of Labrador Retrievers and to explore potential associations of these genotypes with pathologic hepatic copper accumulation. SAMPLE: Archived hepatic specimens from 90 Labrador Retrievers collected between 2013 and 2021. PROCEDURES: The Michigan State University Veterinary Diagnostic Laboratory database was searched to identify archived tissues from Labrador Retrievers that had undergone hepatic histopathologic assessment. Cases were classified into control, copper-associated hepatopathy (CAH), and intermediate populations on the basis of histopathologic features and hepatic copper accumulation. The DNA was extracted from archived tissues and genotyped for reported variants in the 3 genes. Allele frequencies were determined, and associations of genotypes with CAH status were evaluated. RESULTS: 29 control dogs, 45 CAH dogs, and 16 intermediate dogs were included in the study. The overall ATP7A and RETN variant allele frequencies were 30% and 13%, respectively, and were not significantly different among control, CAH, and intermediate populations. The ATP7B variant allele frequency was significantly higher in the CAH population (30%) as compared to the control population (13%). However, 21 of 45 (47%) CAH dogs did not have an ATP7B variant allele whereas 7 of 28 (25%) control dogs did have an ATP7B variant allele. CLINICAL RELEVANCE: Study results supported a contributory role for the ATP7B variant in CAH pathogenesis in Labrador Retrievers. However, the application of genetic testing in a clinical setting is complicated by genotypic variability within healthy and diseased dogs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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