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Enregistrement W4224995766 · doi:10.1128/aem.00035-22

Assessment of Listeria monocytogenes Surface Proteins Identified from Proteomics Analysis for Use as Diagnostic Biomarkers

2022· article· en· W4224995766 sur OpenAlexafffund
Cathy X.Y. Zhang, Brian W. Brooks, Hongsheng Huang, Min Lin

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensUniversity of OttawaCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésListeria monocytogenesBiologyPolyclonal antibodiesListeriaPathogenMicrobiologyBacteriaProteomicsMonoclonal antibodyRecombinant DNAEscherichia coliAntibodyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strains of Listeria monocytogenes are differentiated serologically into at least 13 serotypes and grouped phylogenetically into 4 distinct lineages (I, II, III, and IV). No single monoclonal antibody (MAb) reported to date is capable of binding to the surface of L. monocytogenes strains representing all the serotypes. This study assessed the expression of six surface proteins selected from a previous proteomic study and demonstrated that surface protein LMOf2365_0148 has the greatest potential as a surface biomarker. A panel of 24 MAbs to LMOf2365_0148 were assessed extensively, revealing that one of the MAbs, M3686, reacted to a wide range of L. monocytogenes isolates (lineage I, II, and III isolates) grown under standard enrichment culture conditions and thus led to the conclusion that LMOf2365_0148 is a useful novel surface biomarker for identifying, detecting, and isolating the pathogen from food and environmental samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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