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Enregistrement W4225003249 · doi:10.3390/ijerph19095270

COVID-19 Clinical Profiles and Fatality Rates in Hospitalized Patients Reveal Case Aggravation and Selective Co-Infection by Limited Gram-Negative Bacteria

2022· article· en· W4225003249 sur OpenAlexaff
Kamaleldin B. Said, Ahmed Alsolami, Safia Moussa, Fayez R Alfouzan, Abdelhafiz Ibrahim Bashir, Musleh Rashidi, Rana Aborans, Taha E. Taha, Husam Almansour, Meshari Alazmi, Amal Alotaibi, Luluh Aljaloud, Basmah Al-Anazi, Ahmed Mohammed Ahmed Mohialdin, Ahmed Aljadani

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Environmental Research and Public Health · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensCarleton UniversityMcGill University
Organismes subventionnairesUniversity of Hail
Mots-clésCase fatality rateCoronavirus disease 2019 (COVID-19)MedicineSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakInfection controlBacteriaGram-negative bacteriaIntensive care medicineVirologyEnvironmental healthEmergency medicineBiologyInternal medicineEpidemiologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)OutbreakEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial co-infections may aggravate COVID-19 disease, and therefore being cognizant of other pathogens is imperative. We studied the types, frequency, antibiogram, case fatality rates (CFR), and clinical profiles of co-infecting-pathogens in 301 COVID-19 patients. Co-infection was 36% (n = 109), while CFR was 31.2% compared to 9.9% in non-co-infected patients (z-value = 3.1). Four bacterial species dominated, namely, multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae (37%, n = 48), extremely drug-resistant Acinetobacter baumannii (26%, n = 34), multidrug-resistant Eschericia. coli (18.6%, n = 24), and extremely drug-resistant Pseudomonas aeruginosa (8.5%, n = 11), in addition to other bacterial species (9.3%, n = 12). Increased co-infection of K. pneumoniae and A. baumannii was associated with increased death rates of 29% (n = 14) and 32% (n = 11), respectively. Klebsiella pneumoniae was equally frequent in respiratory and urinary tract infections (UTI), while E. coli mostly caused UTI (67%), and A. baumannii and P. aeruginosa dominated respiratory infections (38% and 45%, respectively). Co-infections correlated with advance in age: seniors ≥ 50 years (71%), young adults 21–49 years (25.6%), and children 0–20 years (3%). These findings have significant clinical implications in the successful COVID-19 therapies, particularly in geriatric management. Future studies would reveal insights into the potential selective mechanism(s) of Gram-negative bacterial co-infection in COVID-19 patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,296

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,351 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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