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Author Correction: Perspectives on ENCODE
Federi Bronwen co Abascal, Reyes Acosta, Nicholas J. Addleman, Jessika Adrian, Veena Afzal, Bronwen Aken, Rizi Ai, Jennifer A. Akiyama, Omar Al Jammal, Henry Amrhein, Stacie M. Anderson, Gregory Andrews, Igor Antoshechkin, Kristin Ardlie, Joel Armstrong, Matthew Astley, Budhaditya Banerjee, Amira Barkal, If H. A. Barnes, Iros Barozzi, Daniel Barrell, Gemma Barson, Daniel Bates, Ulugbek K. Baymuradov, Cassandra Bazile, M Beer, Samantha Beik, M. A. Bender, Ruth Bennett, Louis Philip Benoit Bouvrette, B Bernstein, Andrew Berry, Anand Bhaskar, Alexandra Bignell, Steven M. Blue, David M. Bodine, Carles A. Boix, Nathan Boley, Tyler Borrman, Beatrice Borsari, Alan P. Boyle, Laurel A. Brandsmeier, Alessandra Breschi, Emery H. Bresnick, Jason A. Brooks, Michael Buckley, Christopher B. Burge, Rachel Byron, Eileen Cahill, Lingling Cai, Lulu Cao, Mark Carty, Rosa Castanon, Andrés del Castillo, Hassan Chaı̈b, Esther T. Chan, Daniel R. Chee, Sora Chee, Hao Chen, Huaming Chen, Jiayu Chen, Songjie Chen, J. Michael Cherry, Surya B. Chhetri, Jyoti S. Choudhary, Jacqueline Chrast, Dongjun Chung, Declan Clarke, Neal Cody, Candice J. Coppola, Julie Coursen, Anthony D’Ippolito, Stephen Dalton, Cassidy Danyko, Claire Davidson, José Dávila-Velderrain, Carrie Davis, Job Dekker, Alden Deran, Gilberto DeSalvo, Gloria Despacio-Reyes, Colin N. Dewey, Diane E. Dickel, Morgan Diegel, Mark Diekhans, Vishnu Dileep, Bo Ding, Sarah Djebali, Alexander Dobin, Daniel Domínguez, Sarah Donaldson, Jörg Drenkow, Timothy R. Dreszer, Yotam Drier, Michael O. Duff, Douglass Dunn, Catharine Eastman, Joseph R. Ecker, Matthew D. Edwards, Nicole El-Ali, Shaimae I. Elhajjajy, Keri Elkins, Andrew Emili, Charles B. Epstein, Rachel C. Evans, Iakes Ezkurdia, Kaili Fan, Peggy Farnham, Nina Farrell, Elise A. Feingold, Anne-Maud Ferreira, Katherine Fisher-Aylor, Stephen Fitzgerald, Paul Flicek, Chuan-Sheng Foo, Kevin Fortier, Adam Frankish, Peter Freese, Shaliu Fu, Xiang‐Dong Fu, Y. Fu, Y. Fukuda, Mariateresa Fulciniti, Alister P. W. Funnell, Idan Gabdank, Timur R. Galeev, Mingshi Gao, Carlos García Girón, Tyler H. Garvin, Chelsea Gelboin-Burkhart, Grigorios Georgolopoulos, Mark Gerstein, Belinda Giardine, David K. Gifford, David M. Gilbert, Daniel A. Gilchrist, Shawn Gillespie, T Gingeras, Peng Gong, Álvaro González, José M. González, Peter J. Good, Alon Goren, David U. Gorkin, Brenton R. Graveley, Michael Gray, Jack Greenblatt, Ed Griffiths, Mark Groudine, Fabian Grubert, Mengting Gu, Roderic Guigó, Hongbo Guo, Yuming Guo, Yuchun Guo, Gamze Gürsoy, María Gutiérrez‐Arcelus, Jessica Halow, Ross C. Hardison, Matthew P. Hardy, Manoj Hariharan, Arif Harmanci, Anne Harrington, Jennifer Harrow, Tatsunori Hashimoto, Richard Hasz, Meital Hatan, Eric Haugen, James E. Hayes, Peng He, Yupeng He, Nastaran Heidari, David N. Hendrickson, Elisabeth F. Heuston, Jason A. Hilton, Benjamin C. Hitz, Abigail Hochman, Cory Holgren, Lei Hou, Shuyu Hou, Yun-Hua Esther Hsiao, Shanna Hsu, Hui Huang, Tim Hubbard, Jack Huey, Timothy R. Hughes, Toby Hunt, Sean Ibarrientos, Robbyn Issner, Mineo Iwata, Osagie Izuogu, Tommi Jaakkola, Nader Jameel, Camden Jansen, Lixia Jiang, Peng Jiang, Audra Johnson, Rory Johnson, Irwin Jungreis, Madhura Kadaba, Maya Kasowski, Mary Kasparian, Momoe Kato, Rajinder Kaul, Trupti Kawli, Mike Kay, Judith C. Keen, Sündüz Keleş, Cheryl A. Keller, David R. Kelley, Manolis Kellis, Pouya Kheradpour, Daniel Sunwook Kim, Anthony Kirilusha, Robert J. Klein, Birgit Knoechel, Samantha Kuan, Michael Kulik, Sushant Kumar, Anshul Kundaje, Tanya Kutyavin, Julien Lagarde, Bryan R. Lajoie, Nicole Lambert, John Lazar, Ah Young Lee, Dong-Hoon Lee, Elizabeth Lee, Jin Wook Lee, Kristen Lee, Christina S. Leslie, Shawn Levy, Bin Li, Hairi Li, Nan Li, Shantao Li, Xiang-Rui Li, Yang Li, Ying Li, Yining Li, Yue Li, Maxwell W. Libbrecht, Shin Lin, Yiing Lin, Dianbo Liu, Jason Liu, Peng Liu, Tingting Liu, X. Shirley Liu, Yan Liu, Yaping Liu, Maria Long, Shaoke Lou, Jane Loveland, Aiping Lu, Yuheng Lu, Éric Lécuyer, Lijia Ma, Mark Mackiewicz, Brandon J. Mannion, Michael Mannstadt, Deepa Manthravadi, Georgi K. Marinov, Fergal J. Martin, Eugenio Mattei, Kenneth McCue, Megan McEown, Graham McVicker, Sarah K. Meadows, Alex Meissner, Eric M. Mendenhall, C. Luke Messer, Wouter Meuleman, Clifford A. Meyer, Steve Miller, Matthew G. Milton, Tejaswini Mishra, Dianna E. Moore, Helen M. Moore, Jill E. Moore, Samuel H. Moore, Jennifer Moran, A Mortazavi, Jonathan M. Mudge, Nikhil Munshi, Rabi Murad, R Myers, Vivek Nandakumar, Preetha Nandi, Anil Narasimha, Aditi K. Narayanan, Hannah Naughton, Fábio C. P. Navarro, Patrick A. Navas, Jurijs Nazarovs, Jemma Nelson, Shane Neph, Fidencio Neri, Joseph R. Nery, Amy R. Nesmith, J. Scott Newberry, Kimberly M. Newberry, Vu Ngo, Rosy Nguyen, Thai B. Nguyen, Tung Nguyen, Andrew Nishida, William Stafford Noble, Catherine S. Novak, Eva Maria Novoa, Briana Nuñez, Sara Olson, Ericka Otterman, Hakan Özadam, Michael Pagan, Tsultrim Palden, Xinghua Pan, Yongjin Park, E. Christopher Partridge, Benedict Paten, Florencia Pauli, Michael J. Pazin, Baikang Pei, L Pennacchio, Emily Perry, Dmitri D. Pervouchine, Nishigandha Phalke, Quan Pham, Doug Phanstiel, Ingrid Plajzer-Frick, Henry Pratt, Sebastian Preißl, Jonathan K. Pritchard, Yuri Pritykin, Michael Purcaro, Qian Qin, Giovanni Quinones-Valdez, Ines Rabano, Ernest Radovani, Anil Raj, Nisha Rajagopal, Oren Ram, Lucia Ramirez, Ricardo N. Ramírez, Dylan M. Rausch, Soumya Raychaudhuri, Joseph J. Raymond, Rozita Razavi, Timothy E. Reddy, Thomas Reimonn, Bing Ren, Alexandre Reymond, Alex Reynolds, Suhn K. Rhie, John L. Rinn, Miguel N. Rivera, Juan Carlos Rivera‐Mulia, Brian S. Roberts, José M Calama Rodríguez, Joel Rozowsky, Russell J.H. Ryan, Eric Rynes, Denis Salins, Richard Sandstrom, Takayo Sasaki, Shashank Sathe, Daniel Savic, Alexandra Scavelli, Jonathan Scheiman, Christoph N. Schlaffner, Jeffery A. Schloss, Frank W. Schmitges, Lei Hoon See, Anurag Sethi, Manu Setty, Anthony Shafer, Shuo Shan, Eilon Sharon, Quan Shen, Yin Shen, Richard I. Sherwood, Minyi Shi, Sunyoung Shin, Noam Shoresh, Kyle Siebenthall, Cristina Sisu, Teri Slifer, Cricket A. Sloan, Anna L. Smith, Valentina Snetkova, M Snyder, Damek V. Spacek, Sharanya Srinivasan, Rohith Srivas, George Stamatoyannopoulos, J Stamatoyannopoulos, Rebecca Stanton, Dave Steffan, Sandra Stehling-Sun, J. Seth Strattan, Amanda Su, Balaji Sundararaman, Marie‐Marthe Suner, Tahin Syed, Matt Szynkarek, Forrest Y. Tanaka, Danielle Tenen, Mingxiang Teng, Jeffrey A. Thomas, Dave Toffey, Michael L. Tress, Diane Trout, Gosia Trynka, Junko Tsuji, Sean A. Upchurch, Oana Ursu, Barbara Uszczyńska-Ratajczak, Mia C. Uziel, Alfonso Valencia, Benjamin Van Biber, Arjan G. van der Velde, Eric L. Van Nostrand, Yekaterina Vaydylevich, Jesús Vázquez, Alec Victorsen, Jost Vielmetter, Jeff Vierstra, Axel Visel, Anna Vlasova, Christopher M. Vockley, Simona Volpi, Shinny Vong, Hao Wang, Mengchi Wang, Qin Wang, Ruth Wang, Tao Wang, Wei Wang, Xiaofeng Wang, Yanli Wang, Nathaniel Watson, Xintao Wei, Zhijie Wei, Hendrik Weisser, Sherman M. Weissman, Rene Welch, Robert E. Welikson, Zhiping Weng, Harm-Jan Westra, John W. Whitaker, Collin C. White, Kevin P. White, André Wildberg, Brian A. Williams, David Wine, Heather Witt, B Wold, Maxim Y. Wolf, James C. Wright, Rui Xiao, Xinshu Xiao, Jie Xu, Jinrui Xu, Koon‐Kiu Yan, Yongqi Yan, Hongbo Yang, Xinqiong Yang, Yiwen Yang, Galip Gürkan Yardımcı, Brian A. Yee, G Yeo, Taylor Young, Tianxiong Yu, Chris Zaleski, Chongzhi Zang, Haoyang Zeng, Weihua Zeng, Daniel R. Zerbino, Jie Zhai, Lijun Zhan, Ye Zhan, Bo Zhang, Jialing Zhang, Jing Zhang, Kai Zhang, Lijun Zhang, Peng Zhang, Qi Zhang, Xiao‐Ou Zhang, Zhizhuo Zhang, Yuan Zhao, Zheng Ye, Guoqing Zhong, Xiaoqiao Zhou, Yun Zhu, Jared Zimmerman
Notice bibliographique
RevueNature · 2022
Typeerratum
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcGill UniversitySimon Fraser UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research Institute
Mots-clésENCODEComputational biologyComputer scienceBiologyGeneticsGene
Résumé
In the original article, the authors Rizi Ai (Department of Chemistry and Biochemistry, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA) and Shantao Li (Program in Computational Biology and Bioinformatics, Yale University, New Haven, CT, USA) were mistakenly omitted from the ENCODE Project Consortium author list. The original Article has been corrected online.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,258
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,008 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui