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Enregistrement W4225007529 · doi:10.9778/cmajo.20210323

The impact of shifting demographics, variants of concern and vaccination on outcomes during the first 3 COVID-19 waves in Alberta and Ontario: a retrospective cohort study

2022· article· en· W4225007529 sur OpenAlexafffundvenueabout
Finlay A. McAlister, Majid Nabipoor, Anna Chu, Douglas S. Lee, Lynora Saxinger, Jeffrey A. Bakal

Notice bibliographique

RevueCMAJ Open · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensCanadian VIGOUR CentreUniversity of TorontoUniversity of AlbertaUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMedicineRetrospective cohort studyDemographyPandemicCohortOdds ratioConfidence intervalComorbidityCohort studyDemographicsPopulationVaccinationOddsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineVirologyEnvironmental healthLogistic regressionDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In Canada, published outcome data for COVID-19 come largely from the first 2 waves of the pandemic. We examined changes in demographics and 30-day outcomes after SARS-CoV-2 infection during the first 3 pandemic waves in Alberta and Ontario; for wave 3, we compared outcomes between those infected with a variant of concern and those infected with the original "wild-type" SARS-CoV-2. METHODS: We conducted a population-based retrospective cohort study using linked health care data sets in Alberta and Ontario. We identified all-cause hospitalizations or deaths within 30 days after a positive result on a reverse transcription polymerase chain reaction test for SARS-CoV-2 in individuals of any age between Mar. 1, 2020, and June 30, 2021, with genomic confirmation of variants of concern. We compared outcomes in wave 3 (February 2021 to June 2021) with outcomes in waves 1 and 2 combined (March 2020 to January 2021) after adjusting for age, sex and Charlson Comorbidity Index score. Using wave 3 data only, we compared outcomes by vaccination status and whether or not the individual was infected with a variant of concern. RESULTS: < 0.001) and lower 30-day mortality (aOR 0.73, 95% CI 0.65-0.81). The 217 892 patients in wave 3 who were infected with a variant of concern (83.5% confirmed to have the Alpha variant, 1.7% confirmed to have the Delta variant) had a higher risk of death (Alpha: aOR 1.29, 95% CI 1.16-1.44; Delta: aOR 2.05, 95% CI 1.49-2.82) and hospitalization (Alpha: aOR 1.59, 95% CI 1.53-1.66; Delta: aOR 1.88, 95% CI 1.64-2.15) than those infected with wild-type SARS-CoV-2. INTERPRETATION: We observed a shift among those infected with SARS-CoV-2 toward younger patients with fewer comorbidities, a shorter length of hospital stay and lower mortality risk as the pandemic evolved in Alberta and Ontario; however, infection with a variant of concern was associated with a substantially higher risk of hospitalization or death. As variants of concern emerge, ongoing monitoring of disease expression and outcomes among vaccinated and unvaccinated individuals is important to understand the phenotypes of COVID-19 and the anticipated burdens for the health care system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,593

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2022
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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