Cryo-EM structure of the <i>Agrobacterium tumefaciens</i> T-pilus reveals the importance of positive charges in the lumen
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Agrobacterium tumefaciens is a natural genetic engineer that transfers DNA into plants and this is the most frequently applied process for the generation of genetically modified plants. DNA transfer is mediated by a type IV secretion system localized in the cell envelope and extracellular T-pili. We here report the cryo-electron microscopic structures of the T-pilus at 3.2Å resolution and that of the related plasmid pKM101-determined N-pilus at 3Å resolution. Both pili contain a main pilus protein (VirB2 in A. tumefaciens and TraM in pKM101) and phospholipids arranged in a 5-start helical assembly. They contain positively charged amino acids in the pilus lumen and the lipids are positively charged in the T-pilus (phosphatidylcholine) conferring overall positive charge to the lumen. Mutagenesis of the lumen-exposed Arg91 residue in VirB2 resulted in protein destabilization and loss of pilus formation. Our results reveal that different phospholipids can be incorporated into type IV secretion system pili and that the charge of the lumen is of functional importance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».