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Enregistrement W4225134706 · doi:10.1101/2022.04.25.22274265

Human Germline Heterozygous Gain-of-Function <i>STAT6</i> Variants Cause Severe Allergic Disease

2022· preprint· en· W4225134706 sur OpenAlexafffund
Mehul Sharma, Henry Y. Lu, Maryam Vaseghi‐Shanjani, Kate L. Del Bel, Oriol Fornés, Robin van der Lee, Phillip A. Richmond, Susan Lin, Joshua Dalmann, Jessica J. Lee, Allison Matthews, Géraldine Blanchard‐Rohner, Clara D.M. van Karnebeek, H. Melanie Bedford, Wyeth W. Wasserman, Michael Seear, Margaret L. McKinnon, Hanan Ahmed, Stuart E. Turvey

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEosinophilic Esophagitis
Établissements canadiensMcMaster UniversityNorth York General HospitalGenome British ColumbiaUniversity of TorontoBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of British ColumbiaKillam TrustsGenome British ColumbiaBC Children's HospitalChildren's Hospital Foundation
Mots-clésSTAT6BiologySTAT proteinPhenotypeImmunologyAllergic inflammationAllergyGermlineImmunoglobulin EMissense mutationCytokineGeneImmune systemInterleukin 4GeneticsCancer researchSTAT3Antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT STAT6 (Signal transducer and activator of transcription 6) is a transcription factor that plays a central role in the pathophysiology of allergic inflammation. STAT6 mediates the biological effects of IL-4, a cytokine necessary for type 2 differentiation of T cells and B cell survival, proliferation and class switching to IgE. We have identificated two unrelated patients with a phenotype notable for their early-life onset of profound allergic immune dysregulation, widespread treatment-resistant atopic dermatitis, hypereosinophilia with esosinophilic esophagitis, elevated serum IgE, IgE-mediated food allergies, and vascular anomalies of the brain. Both patients harbored heterozygous de novo missense variants in the DNA binding domain of STAT6 (c.1144G&gt;C, p.E382Q; and c.1256A&gt;G, p.D419G). Functional studies established that both variants caused a gain-of-function (GOF) phenotype associated with enhanced phosphorylation and transcriptional activity of STAT6, in addition to increased transcript abundance of known STAT6 target genes and other genes implicated in allergic disease. JAK inhibitors decreased the enhanced STAT6 responses associated with both these STAT6 GOF variants. This study identifies heterozygous GOF variants in STAT6 as a novel autosomal dominant allergic disorder. We anticipate that our discovery of the first humans with germline STAT6 GOF variants will facilitate the recognition of more affected individuals and the full definition of this new primary atopic disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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