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Enregistrement W4225140008 · doi:10.1039/d2an00200k

2D and 3D maximum-quantum NMR and diffusion spectroscopy for the characterization of enzymatic reaction mixtures

2022· article· en· W4225140008 sur OpenAlexfundno aff
Elena Piersanti, Claudio Righetti, David Ribeaucourt, A. Jalila Simaan, Yasmina Mekmouche, Mickaël Lafond, Jean‐Guy Berrin, Thierry Tron, Mehdi Yemloul

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2022
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueNMR spectroscopy and applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCHIST-ERAFondation Aix-Marseille UniversiteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAgence Nationale de la RechercheAssociation Nationale de la Recherche et de la TechnologieAix-Marseille Université
Mots-clésChemistryCharacterization (materials science)Nuclear magnetic resonance spectroscopyDiffusionRelaxation (psychology)SpectroscopyNMR spectra databaseSubstrate (aquarium)Analytical Chemistry (journal)Spectral lineBiological systemMaterials scienceChromatographyNanotechnologyOrganic chemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

H NMR spectroscopy has been widely used to monitor enzymatic activity by recording the evolution of the spectra of substrates and/or products, thanks to the linear response of NMR. For complex systems involving the coexistence of multiple compounds (substrate, final product and various intermediates), the identification and quantification can be a more arduous task. Here, we present a simple analytical method for the rapid characterization of reaction mixtures involving enzymatic complexes using Maximum Quantum (MaxQ) NMR, accelerated with the Non-Uniform Sampling (NUS) acquisition procedure. Specifically, this approach enables, in the first analytical step, the counting of the molecules present in the samples. We also show, using two different enzymatic systems, that the implementation of these pulse sequences implies precautions related to the short relaxation times due to the presence of metallo-enzymes or paramagnetic catalysts. Finally, the combination of MaxQ and diffusion experiments, which leads to a 3D chart, greatly improves the resolution and offers an extreme simplification of the spectra while giving valuable indications on the affinity of the enzymes to the different compounds present in the reaction mixture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,574
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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