MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4225145323 · doi:10.1016/j.kint.2022.02.042

Application of the International IgA Nephropathy Prediction Tool one or two years post-biopsy

2022· article· en· W4225145323 sur OpenAlexafffund
Sean J. Barbour, Rosanna Coppo, Hong Zhang, Zhihong Liu, Yusuke Suzuki, Keiichi Matsuzaki, Lee Er, Heather N. Reich, Jonathan Barratt, Daniel Cattran, María Luisa Russo, S. Troyanov, H. Terence Cook, Ian S.D. Roberts, Vladimı́r Tesař, Dita Maixnerová, Sigrid Lundberg, Loreto Gesualdo, Francesco Emma, Laura Fuiano, G. Beltrame, Cristiana Rollino, Alfonso Amore, Roberta Camilla, Licia Peruzzi, Manuel Praga, Sandro Feriozzi, Rosaria Polci, Giuseppe Segoloni, Loredana Colla, Antonello Pani, Doloretta Piras, Andrea Angioi, Giovanni Cancarini, S. Ravera, Magdalena Durlik, Elisabetta Moggia, José Ballarín, S. Di Giulio, Francesco Pugliese, I. Serriello, Mehmet Şükrü Sever, İşın Kiliçaslan, Francesco Locatelli, Lucia Del Vecchio, Jack F.M. Wetzels, Harm Peters, U. Berg, Fernanda Carvalho, A.C. da Costa Ferreira, M. Maggio, Andrzej Więcek, Mai Ots-Rosenberg, Riccardo Magistroni, Rezan Topaloğlu, Yelda Bilginer, Marco DʼAmico, Μaria Stangou, F Giacchino, Dimitrios Goumenos, Evangelos Papachristou, Kres̆imir Gales̃ić, Colin Geddes, Kostas C. Siamopoulos, Olga Balafa, Marco Galliani, Piero Stratta, Marco Quaglia, R Bergia, Raffaella Cravero, Maurizio Salvadori, Lino Cirami, Bengt Fellström, Hilde Kloster Smerud, Franco Ferrario, T. Stellato, Jesús Egido, Carina Aguilar Martín, Jürgen Floege, Frank Eitner, Antonio Lupo, Patrizia Bernich, Paolo Mené, Massimo Morosetti, Cees van Kooten, Ton J. Rabelink, Marlies E. J. Reinders, J.M. Boria Grinyo, Stefano Cusinato, Luisa Benozzi, Silvana Savoldi, C. Licata, Małgorzata Mizerska-Wasiak, G Martina, A Messuerotti, Antonio Dal Canton, Ciro Esposito, C. Migotto, G Triolo, Filippo Mariano, Claudio Pozzi, R Boero, Shubha S. Bellur, Gianna Mazzucco, C. Giannakakis, Eva Honsová, B. Sundelin, Anna Maria Di Palma, Ester Gutiérrez, A.M. Asunis, Regina Tardanico, Agnieszka Perkowska‐Ptasińska, J. Arce Terroba, M. Fortunato, Afroditi Pantzaki, E. J. Steenbergen, M. Soderberg, Živile Riispere, Luciana Furci, Dıclehan Orhan, David Kipgen, Donatella Casartelli, Danica Galešić Ljubanović, Hariklia Gakiopoulou, E. Bertoni, Pablo Cannata Ortiz, Henryk Karkoszka, H.-J. Groene, Antonella Stoppacciaro, Ingeborg M. Bajema, Jan A. Bruijn, Jadwiga Małdyk, E. Ioachim, Nüket Bavbek, Terence Cook, Charles E. Alpers, F. Berthoux, Stephen M. Bonsib, Vivette D. D’Agati, Giuseppe D’Amico, Steven N. Emancipator, F. Emmal, Fernando C. Fervenza, Sandrine Florquin, Agnes B. Fogo, Mark Haas, P. Hill, Ronald J. Hogg, Stephen I‐Hong Hsu, Tracy E. Hunley, Michelle Hladunewich, Caroline E. Jennette, Kensuke Joh, Bruce A. Julian, Takeshi Kawamura, F M Lai, Chi Bon Leung, L. Li, P. Li, Bruce Mackinnon, Sergio Mezzano, Francesco Paolo Schena, Yasuhiko Tomino, Patrick D. Walker, H. Wang, J J Weening, Nori Yoshikawa, Caihong Zeng, Sufang Shi, Chieko Nogi, Hidenobu Suzuki, Kentaro Koike, Keita Hirano, Takashi Yokoo, M. Hanai, Kei Fukami, Kazuo Takahashi, Y. Yuzawa, Misao Niwa, Yoshinari Yasuda, Shoji Maruyama, Daisuke Ichikawa, Takahide Suzuki, Sayuri Shirai, Akihisa Fukuda, Shota Fujimoto, Hernán Trimarchi

Notice bibliographique

RevueKidney International · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCollege of Medicine, University of FloridaCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of North Carolina at Chapel HillInstituto de Investigación Sanitaria Fundación Jiménez DíazNanjing UniversityJikei University School of MedicineTartu ÜlikoolSt Vincent's Hospital MelbourneFondazione Ricerca MolinetteUniversity of MiyazakiRadboud Universitair Medisch CentrumUniversità degli Studi di TorinoOxford University Hospitals NHS Foundation TrustLeids Universitair Medisch CentrumChinese University of Hong KongNational and Kapodistrian University of AthensKarolinska InstitutetUniversity of North Carolina WilmingtonUniversiteit van AmsterdamErasmus Medisch CentrumUniversity of OxfordIstanbul ÜniversitesiImperial College LondonPeking University First HospitalSapienza Università di RomaMayo ClinicOspedale Pediatrico Bambino GesùUniversidad Autónoma de MadridWarszawski Uniwersytet MedycznyToronto East General Hospital FoundationHealth Sciences Center New Orleans, Louisiana State UniversityUniversiteit LeidenUniverzita Karlova v PrazeDeutsches KrebsforschungszentrumPeking UniversityŚląski Uniwersytet MedycznyCedars-Sinai Medical CenterWakayama Medical UniversityAristotle University of ThessalonikiVanderbilt UniversityFujita Health UniversityHacettepe ÜniversitesiUniversity of TorontoCase Western Reserve University
Mots-clésNephropathyMedicineBiopsyRenal biopsyInternal medicinePathologyEndocrinologyDiabetes mellitus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The International IgA Nephropathy (IgAN) Prediction Tool is the preferred method in the 2021 KDIGO guidelines to predict, at the time of kidney biopsy, the risk of a 50% drop in estimated glomerular filtration rate or kidney failure. However, it is not known if the Prediction Tool can be accurately applied after a period of observation post-biopsy. Using an international multi-ethnic derivation cohort of 2,507 adults with IgAN, we updated the Prediction Tool for use one year after biopsy, and externally validated this in a cohort of 722 adults. The original Prediction Tool applied at one-year without modification had a coefficient of variation (R 2 ) of 55% and 54% and four-year concordance (C statistic) of 0.82 but poor calibration with under-prediction of risk (integrated calibration index (ICI) 1.54 and 2.11, with and without race, respectively). Our updated Prediction Tool had a better model fit with higher R 2 (61% and 60%), significant increase in four-year C-statistic (0.87 and 0.86) and better four-year calibration with lower ICI (0.75 and 0.35). On external validation, the updated Prediction Tool had similar R 2 (60% and 58%) and four-year C-statistics (both 0.85) compared to the derivation analysis, with excellent four-year calibration (ICI 0.62 and 0.56). This updated Prediction Tool had similar prediction performance when used two years after biopsy. Thus, the original Prediction Tool should be used only at the time of biopsy whereas our updated Prediction Tool can be used for risk stratification one or two years post-biopsy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueKidney InternationalMême sujetRenal Diseases and GlomerulopathiesTravaux en français237 207