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Enregistrement W4225289102 · doi:10.4049/jimmunol.2101170

Analysis of Complement Gene Expression, Clinical Associations, and Biodistribution of Complement Proteins in the Synovium of Early Rheumatoid Arthritis Patients Reveals Unique Pathophysiologic Features

2022· article· en· W4225289102 sur OpenAlexaff
Nirmal K. Banda, Kevin D. Deane, Elizabeth A. Bemis, C. Strickland, Jennifer Seifert, Kimberly R. Jordan, Katriona Goldman, B. Paul Morgan, Larry W. Moreland, Myles Lewis, Costantino Pitzalis, V. Michael Holers

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Diseases and Glomerulopathies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesAnschutz Medical Campus, University of ColoradoNational Institutes of HealthFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésMedicineComplement systemRheumatoid arthritisImmunologySynovitisArthritisAutoantibodyPathophysiologyInternal medicinePathologyImmune systemAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Rheumatoid arthritis (RA) is an autoimmune disease characterized by synovial hyperplasia and inflammation. The finding of autoantibodies in seropositive RA suggests that complement system activation might play a pathophysiologic role due to the local presence of immune complexes in the joints. Our first objective was to explore the Pathobiology of Early Arthritis Cohort (PEAC) mRNA sequencing data for correlations between clinical disease severity as measured by DAS28-ESR (disease activity score in 28 joints for erythrocyte sedimentation rate) and complement system gene expression, both in the synovium and in blood. Our second objective was to determine the biodistribution using multiplex immunohistochemical staining of specific complement activation proteins and inhibitors from subjects in the Accelerating Medicines Partnership (AMP) RA/SLE study. In the PEAC study, there were significant positive correlations between specific complement gene mRNA expression levels in the synovium and DAS28-ESR for the following complement genes: C2, FCN1, FCN3, CFB, CFP, C3AR1, C5AR1, and CR1. Additionally, there were significant negative correlations between DAS28-ESR and Colec12, C5, C6, MASP-1, CFH, and MCP. In the synovium there were also significant positive correlations between DAS28-ESR and FcγR1A, FcγR1B, FcγR2A, and FcγR3A. Notably, CFHR4 synovial expression was positively correlated following treatment with the DAS28-ESR at 6 mo, suggesting a role in worse therapeutic responses. The inverse correlation of C5 RNA expression in the synovium may underlie the failure of significant benefit from C5/C5aR inhibitors in clinical trials performed in patients with RA. Multiplex immunohistochemical analyses of early RA synovium reveal significant evidence of regional alterations of activation and inhibitory factors that likely promote local complement activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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