Characterization of differential gene expression of broiler chicken to thermal stress in discrete developmental stages
Notice bibliographique
Résumé
Prolonged exposure to high temperatures is linked to a range of physiological responses in broiler chickens including reduced disease resistance, low growth rate, and high mortality rate. In this study, we investigated the effect of heat stress on gene expression levels in 4-week-old and 6-week-old chickens each exposed to environments conditioned at thermoneutral (21 °C) and high (32 °C) temperatures. The analysis of differentially expressed genes (DEGs) using microarray revealed that genes underlying reactive oxygen species (ROS) production, cell nutrient intake, glucose metabolism, and circadian rhythm were differentially regulated in association with heat stress. We also found that the deviation in expression levels across the transcriptome in response to heat stress was significantly stronger (P< 2.2×10−16) in 6-week-olds compared to younger chickens. We finally observed a significant trend (r = 0.78, P< 2.2×10−16) that genes with a higher estimate of expression in the microarray were more likely to have a higher expression level in RNA-sequencing. Together, our findings provide comprehensive insights into the physiology involved in stress responses at varying developmental stages, which may facilitate chicken breeding to maximize their productivity under adverse conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».