Enzymatic removal of cell surface antigens as a route towards universal O type blood and organs
Notice bibliographique
Résumé
Mammalian cell surfaces are coated in specific sugar structures, many of which function as antigens and are involved in cellular recognition. Important examples are the oligosaccharide A, B, and H antigens present on red blood cells that differentiate the A, B and O blood types. Enzymatic cleavage of the GalNAc and Gal residues from the cell surface would allow conversion of A and B red blood cells, respectively, to O type. Since Type O blood can be universally donated to patients with the same Rh factor, access to efficient enzymes would greatly broaden and simplify blood supply. We have sought such enzymes in metagenomic libraries derived from the human gut microbiome. Total DNA was extracted from feces samples, fragmented into pieces containing ~30‐40 genes (40‐50 kB) and transformed into E. coli. After picking colonies into 384 well plates we screened them for enzymes that can be used to remove the Gal or GalNAc residues that function as the antigenic determinants from A and B type red blood cells, thereby generating “universal” O type blood. A set of efficient enzymes of a new class has been identified and characterized and used to convert whole units of A blood to O. These enzymes work approximately 30 times faster than any previously characterized and with high specificity. Further, they function well in whole blood thus can be hopefully integrated into the current blood processing process. 1 These enzymes also function well on tissue surfaces and, when perfused through donated human A‐type lungs successfully cleared A‐antigen from surfaces exposed to the blood. Subsequent perfusion of the lungs with O‐type plasma to mimic an ABO‐incompatible transplant showed that antigen removal minimized antibody binding and antibody‐mediated injury relative to the control lung, thus may greatly temper the acute rejection phase. 2 This could allow expansion of ABO‐incompatible lung transplantations, leading to significant improvements in logistics and fairness of organ allocation. Rahfeld, P. et al. “An enzymatic pathway in the human gut microbiome that converts A to universal O‐type blood” (2019) Nature Microbiology 4, 1475‐1485. Wang et al Conversion of blood type A donor lungs into universal blood type lungs using ex vivo ABO enzymatic treatment” (2022) Science Translational Medicine In Press, Scheduled Feb 2022
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».