Effects of spliceosomal mutations on brain patterning and morphogenesis
Notice bibliographique
Résumé
The major spliceosome consists of U1, U2, U5, and U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein (snRNPs), and each snRNP has distinct and sequential roles during the mRNA splicing process. Mutations in the core components of the spliceosome are associated with brain and neurological defects. The goal of this study is to examine the role of three core spliceosomal components, SNRPB, SF3B4, and EFTUD2, in brain patterning and morphogenesis, and whether or not they are required in the neural tube or neural crest cells for brain development. Previously, we identified brain defects associated with the mutation of these spliceosomal components in the neural tube and neural crest cells. Structures derived from the midbrain and hindbrain region, such as the diencephalon, pons, and cerebellum, were found to be absent in E12.5 and E14.5 mutant embryos. In this study, we aim to use mutant mouse models to identify shared transcripts and pathways disrupted by mutations in these spliceosomal genes. Through RNA‐seq analysis, we identified a number of mis‐expressed RNA‐binding proteins that may contribute to the malformationis found in these mutants. We plan to examine level and expression of these RNA binding proteins in wild type and mutant embryos to evaluate how they contribute to the phenotypes found. Furthermore, to assess the potential clinical application of our findings, we will use human embryonic stem cells (hESC) to generate human neural crest cells with mutatioin in these splicing factors; shared transcripts and pathways identified in the mouse model will be compared to those found in induced human neural crest cells. Distinct spliceosomophathies are difficult to diagnose due to phenotypic overlaps. The significance of this work lies in its potential to identify a disrupted pathway shared by mutations in various splicing factors, a therapeutic alternative across multiple spliceosomopathies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».