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Enregistrement W4225384348 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r3312

Functional Comparison of Human and Murine Equilibrative Nucleobase Transporter 1

2022· article· en· W4225384348 sur OpenAlexaff
Chan S. Kim, Nicholas M. Ruel, James R. Hammond

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy and Medication Impact
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThiopurine methyltransferaseHEK 293 cellsTransporterTransfectionPharmacologyKnockout mouseCytotoxicityGene knockoutBiologyCell cultureChemistryMedicineIn vitroBiochemistryDiseaseGeneticsGeneAzathioprineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Thiopurines are a key component for the immunosuppressive therapy of various leukemias, inflammatory bowels disease, and other autoimmune disorders. Thiopurine therapy discontinuation/interruption is associated with a higher risk of relapse, but is common due to the prevalence of severe and potentially fatal adverse events, such as hepatotoxicity. Drug transporter expression is a known factor for patient variability in drug response and toxicity. We have recently established that the SLC43A3‐encoded transporter, equilibrative nucleobase transporter 1 (ENBT1), is the primary mechanism by which the thiopurine, 6‐mercaptopurine (6‐MP) enters cells. ENBT1 is known to be highly expressed in human hepatocytes, however, the relationship between ENBT1 and thiopurine‐induced hepatotoxicity has not been explored in the literature. To investigate this paradigm, our lab has proposed developing a novel SLC43A3 knockout mouse model. However, the functional differences between human and murine ENBT1, in mediating 6‐MP transport, has equally not been explored. Evidence that suggests ENBT1 is functionally similar between species, would be an essential foundation to assist bridging the gap between our proposed animal model and clinical studies within the literature. Hypothesis We hypothesize that hSLC43A3‐encoded hENBT1 and mslc43a3‐encoded mENBT1 are functionally similar and will have non‐significantly different 6‐MP transport kinetics and resulting cytotoxicity. Methods The ENBT1‐deficient human embryonic kidney 293 (HEK293) cell line was stably transfected with either hSLC43A3 or mslc43a3. [ 3 H]Adenine and [ 3 H]6‐MP were used in an oil‐stop centrifugation assay to assess ENBT1‐mediated transport activity in wildtype and transfected HEK293 cell lines. To determine cytotoxicity, wildtype and transfected HEK293 cell lines were incubated for 48 hours with a range of 6‐MP concentrations (78 nM – 1.28 mM) before being assessed via MTT cell viability assay. Results Oil stop centrifugation assay of ENBT1‐mediated [ 3 H]adenine and [ 3 H]6‐MP transport revealed that hENBT1 and mENBT1 have similar transport kinetics (K m and V max ), where resulting Michaelis‐Menten curves were not significantly different (unpaired T‐test: Adenine ‐ t 16 =0.32, p=0.76, n=5 & 6‐MP ‐ t 16 =0.64, p=0.53, n=4). Adenine inhibition of ENBT1‐mediated [ 3 H]6‐MP transport and 6‐MP inhibition of ENBT1‐mediated [ 3 H]adenine transport also showed that hENBT1 and mENBT1 have concurring inhibition kinetics (K i ), inhibition curves were not significantly different (unpaired T‐test: Adenine: t 17 =0.29, p=0.77, n=5 & 6‐MP: t 14 =0.18, p=0.86, n=4). Subsequent MTT cell viability assay showed that wildtype HEK293 are relatively 6‐MP resistant, while the transfected‐HEK293s are 6‐MP sensitive and have non‐significantly different cell viability curves (unpaired T‐test: t 28 =0.13, p=0.89, n=5). Conclusion Our results show that hENBT1 and mENBT1 are functionally similar in regards to ENBT1‐mediated adenine and 6‐MP transport in a stably transfected cell line. Additional work is necessary to investigate whether this is the case in human and murine hepatic cell lines/primary hepatocytes that have endogenous SLC43A3/ENBT1 expression and a larger range of xenobiotic metabolizing enzymes that may alter the equilibrium of 6‐MP within cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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