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Enregistrement W4225393384 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r3842

Comparative Analysis of Annexin A1 (ANXA1) Protein Expression in Different Cancer Types

2022· article· en· W4225393384 sur OpenAlexaff
Karyn Olascuaga‐Castillo, Susana Rubio‐Guevara, Elena Cáceres‐Andonaire, Olga E. Caballero-Aquiño, Julio Hilario‐Vargas, Dan Altamirano‐Sarmiento, José Andrés Morgado‐Díaz, Maxim V. Berezovski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional de Trujillo
Mots-clésAnnexin A1AnnexinExpression (computer science)Protein expressionAnnexin A2CancerCancer researchMedicineBiologyInternal medicinePathologyComputer scienceBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Annexin A1 (ANXA1) is the first member of the Lipocortin family, a calcium‐dependent phospholipid‐binding protein with potent immunomodulatory activity. ANXA1 is related to cellular proliferation, apoptosis, progression, and metastasis in cancer, and its expression is variable depending on the tumor type. Our research will compare the expression of ANXA1 in various forms of cancer and establish if the protein is up‐or down‐regulated. Methods We analyzed 1904 immunohistochemistry datasets from The Human Protein Atlas (HPA). The samples represent 20 different forms of cancer from 455 patients. The expression of ANXA1 was compared to the same in tissue samples from 137 healthy subjects, which meant the tissues of origins of primary tumors. The levels of ANXA1 expression were quantified using a visual grading method based on staining intensity (I) and cell fraction stained (F). The Q score (combination of stained cell fraction and staining intensity) was obtained by the product of (F)*(I). Results 9 of 20 cancer types showed increased protein expression (up‐regulation) comparison to their healthy counterparts. Eight cancer types showed decreased protein expression (down‐regulation). Three types of cancer showed no significant differences. Conclusion ANXA1 expression may serve as an important diagnostic marker for such a variety of different cancer types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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