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Enregistrement W4225398728 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r5166

Structure of a Therapeutic Antibody in Complex with MUC16 Reveals a Conformational Epitope Influenced by Antigen Glycosylation

2022· article· en· W4225398728 sur OpenAlexaff
Cory L. Brooks, Eric N. Aguilar, Brandy J. White, Henk van Faassen, Sarah Michaud, David R. Goodlett, Teresa M. Brooks, Greg Hussack, Kevin A. Henry, Prakash Radhakrishnan

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of VictoriaNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésEpitopeConformational epitopeLinear epitopeAntibodyEpitope mappingChemistryMolecular biologyAntigenChinese hamster ovary cellHumanized antibodyBiologyCancer researchMonoclonal antibodyBiochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integral membrane glycoprotein Mucin‐16 (MUC16) has emerged as an important cancer antigen that displays a high degree of tumor selectivity. MUC16 is often overexpressed and involved in tumorigenesis in several malignancies, including pancreatic and ovarian cancer. The role of MUC16 in cancer progression is complex and provides multiple points for therapeutic intervention. However, despite clinical interest in MUC16 as an immunotherapy target, surprisingly little is known regarding how antibodies bind the protein. Here we report the humanization, epitope mapping, and structure determination of a MUC16 specific therapeutic antibody. The antibody was humanized using a germline complementary determining region (CDR) loop grafting approach and produced by transient transfection in Chinese hamster ovary (CHO) cells. The humanized and murine antibodies displayed nearly identical binding affinity to a recombinant MUC16 SEA ( S perm protein, E nterokinase, and Agrin) domain as measured by enzyme linked‐immunosorbent assay (ELISA) and surface plasmon resonance (SPR). High‐resolution x‐ray structures of the antibodies indicated no significant changes associated with humanization. Initial epitope mapping using an ELISA and overlapping MUC16 constructs suggested that the antibody epitope was localized to a SEA domain and was non‐linear and conformational in nature. A more detailed epitope mapping study carried out using hydrogen‐deuterium exchange mass‐spectrometry revealed five regions on the SEA domain that resulted in reduced deuteration when the antibody was bound to the antigen. These results were confirmed by x‐ray structures of the murine and humanized antibodies complex with the SEA domain. The structures revealed a complex, non‐linear structural epitope with a long b‐hairpin forming the center of the interaction. Finally, a fully glycosylated recombinant SEA domain was produced by transient transfection in CHO cells and used to assess the role of MUC16 glycosylation on antibody binding. Surprisingly, the densely glycosylated SEA domain bound the antibody with approximately 2‐fold higher affinity compared to the unglycosylated domain, suggesting a role for antigen glycosylation in mediating antibody binding. The results presented here represent the first structural characterization of an antibody in complex with MUC16 and reveal a complex, non‐linear epitope influenced by glycosylation. These findings will help to accelerate the clinical development of this promising therapeutic agent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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