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Enregistrement W4225399109 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r3339

A Truncated Mutant – The Most Common Sucrase‐Isomaltase Deficiency in the Inuit Population: Cellular and Biochemical Characterization

2022· article· en· W4225399109 sur OpenAlexaboutno aff
Stephanie Tannous, Hassan Y. Naim

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésMutantPopulationGlycosylationMalabsorptionMutationWild typeBiologyMolecular biologyBiochemistryChemistryEndocrinologyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sucrase isomaltase (SI) is the most prominent disaccharidase in the small intestine responsible for the final steps of carbohydrate digestion. Mutations in the SI gene can lead to a drastic reduction or loss of the catalytic activity required for digestion of disaccharides, and thus can be associated with maldigestion and malabsorption of carbohydrates. Carbohydrate malabsorption is one of the most common gastrointestinal problems, where 70% of the population are affected. Congenital sucrase‐isomaltase deficiency (CSID) is an autosomal recessive disorder caused by defective SI activity; and it is clinically characterized by abdominal pain, flatulence, bloating, and diarrhea. Recently, a homozygous frameshift mutation, c.273_274delAG (p.Gly92Leufs*8), was identified in the Inuit population with an observed allele frequency of 17.2%. In this study, Cos‐1 cells were transiently transfected with cDNA encoding the Gly92Leufs*8 mutation or SI wild‐type (SI‐WT) as a control. The assessment of this new variant phenotype was investigated through enzymatic activity measurements, cellular localization and trafficking behavior. The truncation is associated with the elimination of all N‐glycosylation sites, whereas the Ser/Thr‐rich stalk region is retained pointing to a potential O‐glycosylation. In fact, treatment with benzyl 2‐acetamido‐2‐deoxy‐α‐D‐galactopyranoside, an inhibitor of O‐glycosylation in the Golgi, resulted in a substantial shift in the size of the mutant concomitant with transport competence of the mutant to O‐glycosylation in the Golgi Apparatus. The mutant is further trafficked to the cell surface as assessed by the detection of biotinylated forms of the mutant at the cell surface. This result was also corroborated by immunofluorescence images, which revealed the mutant at the cell surface. However, this mutant does not exhibit SI activity due to the absence of the sucrase and isomaltase domains. While our data unraveled the molecular basis for the onset of the clinical symptoms in patients homozygous to this mutation, further work is needed to determine whether heterozygotes with this mutation are also affected and to which extent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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