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Enregistrement W4225425393 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r6052

Deletion of <i>Sf3b4</i> in Neural Crest Cells Encapsulates the Variable Expressivity of Craniofacial Abnormalities Observed in Nager and Rodriguez Syndrome Patients

2022· article· en· W4225425393 sur OpenAlexafffund
Shruti Kumar, Sabrina Alam, Marie‐Claude Beauchamp, Jacek Majewski, Loydie A. Jerome‐Majewska

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCraniofacial Disorders and Treatments
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeural crestBiologyCraniofacialHindbrainNeural tubeAnatomyGeneticsEmbryo

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recently, both Nager syndrome and Rodriguez syndrome patients were identified to carry rare mutations in SF3B4 . Both disorders affect the face as well as the limb including both hands and feet. Nager syndrome patients survive and exhibit smaller jaw bones, smaller cheek bones, cleft palate, hearing problems as well as downward slanted eyelids. However, Rodriguez syndrome is much more severe, and patients often die before or soon after birth. We hypothesized that craniofacial abnormalities associated with reduced SF3B4 levels is due to tissue‐specific expression and requirement of this gene in neural crest cells. To generate a conditional mutant mouse line for Sf3b4, we used CRISPR/Cas9 to insert LoxP sequences in intron 1 and 3 of this gene. To test our hypothesis, we mated Sf3b4 conditional mutant mice to Wnt1 ‐ Cre2 transgenic mice to delete exons 2 and 3 specifically in neural crest cells. Heterozygous mutant embryos from these matings were normal. Sf3b4 L/L ; Wnt1‐Cre2 embryos have brain and craniofacial abnormalities, including abnormal forebrain, midbrain and hindbrain, hypoplasia of the maxillomandibular region and midline cleft. Majority of these embryos die before birth and the few mutants that are born are indistinguishable from their wildtype littermates. Additionally, we generated Sf3b4 L/‐; Wnt1‐Cre2 mutants with homozygous deletion of Sf3b4 in neural crest cells and heterozygous deletion of Sf3b4 in the body. These mutant embryos also had unfused frontonasal prominence and unfused and severely hypoplastic mandibular region. Sf3b4 L/‐; Wnt1‐Cre2 begin to die at E13.5 and none survive to birth. Thus, neural crest specific deletion of Sf3b4 in mice is able to model the craniofacial abnormalities presented in patients as well as capture the variable expressivity observed. Our model can further be used to uncover the splicing and molecular events regulated by SF3B4 during craniofacial development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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