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Enregistrement W4225880055 · doi:10.1136/jmedgenet-2021-108341

<i>FXR1</i>-related congenital myopathy: expansion of the clinical and genetic spectrum

2022· article· en· W4225880055 sur OpenAlexaff
Magdalena Mroczek, Cheryl Longman, Maria Elena Farrugia, S. Kapetanovic García, Didem Ardıçlı, Haluk Topaloğlu, Aurelio Hernández‐Laín, Dıclehan Orhan, Mehmet Alikaşifoğlu, Jennifer Duff, Sabine Specht, Kristen L. Nowak, Gianina Ravenscroft, Katherine R. Chao, Zaheer M. Valivullah, Sandra Donkervoort, Dimah Saade, C. Bönnemann, Volker Straub, Grace Yoon

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteMuscular Dystrophy UKNational Health and Medical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Eye InstituteGenzymeKurt+Peter FoundationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute for Health and Care ResearchLimb Girdle Muscular Dystrophy 2i Research FundUltragenyx Pharmaceutical
Mots-clésMyopathyCongenital myopathyMuscle biopsyHypotoniaPhenotypeExome sequencingMedicineMuscle weaknessPathologyBiologyBiopsyGeneticsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Biallelic pathogenic variants in FXR1 have recently been associated with two congenital myopathy phenotypes: a severe form associated with hypotonia, long bone fractures, respiratory insufficiency and infantile death, and a milder form characterised by proximal muscle weakness with survival into adulthood. Objective We report eight patients from four unrelated families with biallelic pathogenic variants in exon 15 of FXR1 . Methods Whole exome sequencing was used to detect variants in FXR1 . Results Common clinical features were noted for all patients, which included proximal myopathy, normal serum creatine kinase levels and diffuse muscle atrophy with relative preservation of the quadriceps femoris muscle on muscle imaging. Additionally, some patients with FXR1 -related myopathy had respiratory involvement and required bilevel positive airway pressure support. Muscle biopsy showed multi-minicores and type I fibre predominance with internalised nuclei. Conclusion FXR1 -related congenital myopathy is an emerging entity that is clinically recognisable. Phenotypic variability associated with variants in FXR1 can result from differences in variant location and type and is also observed between patients homozygous for the same variant, rendering specific genotype–phenotype correlations difficult. Our work broadens the phenotypic spectrum of FXR1 -related congenital myopathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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